Vendredi 22 Novembre 2024

GBIF

Du 22 au 23 juin 2017, des membres du Secrétariat du GBIF ont rejoint les partenaires du réseau et les représentants des nouveaux projets financés par le programme BID  (Biodiversity Information for Development ou Information pour le Développement de la Biodiversité) de la région des Caraïbes, pour un atelier de deux jours à l'Université des Antilles à Saint-Augustin, Trinité-et-Tobago.

Le rassemblement a permis aux participants de développer le travail réalisé au cours des deux jours précédents durant l'atelier de renforcement des capacités de BID Caribbean réunissant de nouveaux bénéficiaires, une équipe internationale de formateurs et de mentors du réseau GBIF et du personnel du Secrétariat. Le hashtag Twitter #GBIFBID a permis aux personnes intéressées de suivre les événements à distance.

L'atelier couvre les sujets suivants:

    - Besoins et options proposées pour organiser l'information sur la biodiversité dans les Caraïbes
    - Développement des capacités en s'appuyant sur les réseaux existants, notamment BIOPAMA et GBIF Amérique latine
    - Options régionales pour l'accès aux données en ligne et le développement de portail(s)
    - Construire une feuille de route pour améliorer l'information sur la biodiversité dans les Caraïbes

Les participants ont également pu voir des présentations sur les huit projets financés récemment par le programme BID Caribbean.

Plus d'informations sur cette page (en anglais)

Crédit : Marie-Elise Lecoq, sous licence CC BY.

Challenge Ebbe-Nielsen 2017 du GBIF

Le GBIF Ebbe Nielsen Challenge 2017 décernera des prix pour un total de 14 000€  aux développeurs et scientifiques créant des outils pour améliorer l'accessibilité et l'interopérabilité des données de biodiversité disponibles dans les entrepôts de données libres, permettant ainsi de plus vastes explorations scientifiques et réutilisations de celles-ci.

Le Challenge repose sur l'adoption croissante de stratégies open data par les journaux scientifiques et les organismes de financement de la recherche. Afin de respecter ces règles, les chercheurs doivent mettre en libre accès les données à l'origine de leurs travaux, la plupart du temps en déposant leurs jeux de données dans des entrepôts de données en accès libre comme Dryad et Figshare.

Le Ebbe Nielsen Challenge 2017 demande aux participants de développer des applications web, scripts ou autres outils pour automatiser la découverte et l'extraction des données de biodiversité pertinentes dans les entrepôts de données en libre accès. Ces outils doivent permettre de générer des jeux de données prêts pour la publication sur le GBIF.org grâce à l'une des méthodes suivantes :

  • Recherche automatique de données ouvertes disponibles dans les entrepôts de données publics
  • Extraction efficace des informations nécessaires pour générer des checklists, des jeux de données d'occurrences d'espèces ou d'échantillonnage (par exemple nom scientifique, date, localisation de l'occurrence, etc.) à partir des jeux de données dans ces entrepôts
  • Correspondance (mapping)des en-têtes de colonnes et/ou de leur contenu avec les termes du standard Darwin Core
  • Conversion automatisée des données formatées en Archives Darwin Core prêtes pour la publication sur le GBIF.org

Beaucoup de jeux de données accessibles dans des entrepôts de données ont une structure tabulaire et contiennent les informations de base nécessaires à la génération de données d'occurrences d'espèces : noms scientifiques, dates, localisations géographiques, quantités, ainsi que d'autres éléments intéressants pouvant être standardisés. Si les jeux de données possèdent une licence CC0, CC BY ou CC BY-NC (utilisées dans le réseau GBIF), ils sont adaptés à être réutilisés, republiés et partagés (avec citation adéquate) avec un public très large de chercheurs du monde entier.

Les soumissions pour le Challenge doivent concevoir des processus pour préparer ces jeux de données au format Darwin Core Archive (DwC-A), qui permet actuellement la publication de quasiment 800 millions enregistrements d'occurrences d'espèces dans le réseau GBIF, qui comprend plus de 1000 institutions éditrices de données.

Le jury provisoire pour l'édition 2017 du Challenge inclut :

La période de soumission va du 15 juin au 05 septembre 2017. Les participants doivent enregistrer chaque membre de l'équipe sur DevPost, qui héberge tous les documents et règles liés au Challenge. Allez sur le site https://gbif2017.devpost.com pour plus de détails sur les conditions de participation.

Le Secrétariat du GBIF, situé à Copenhague (Danemark) est à la recherche d'un développeur de logiciels expérimenté ayant une expérience dans les pratiques de DevOps et dans le travail avec une petite équipe. Il s'agit d'un poste à temps complet situé à Copenhague.

La fiche de poste est disponible sur cette page (en anglais) ; pour plus d'informations, cliquez ici (en anglais également).

La date limite de candidature pour le poste est fixée au lundi 17 juillet 2017 ; envoyer CV, lettre de motivation et pseudonyme github (en anglais) à l'adresse datadev-job1-2017@gbif.org

Le Secrétariat du GBIF a récemment ouvert les nominations pour le Young Researchers Award 2017. Ce prix cherche à soutenir la recherche et les innovations qui utilisent les données rendues accessibles par le GBIF, en se focalisant cette année sur la publication de jeux de données proposant des informations détaillées sur les espèces observées ou collectées au cours d'événements d'échantillonnage (voir la récente mise à jour du standard de données Darwin Core à ce sujet).

Cette année, le GBIF décernera deux prix de 5000€ chacun : un pour le travail d'un doctorant et l'autre pour celui d'un étudiant de master. Les étudiants qui le souhaitent peuvent postuler via le Chef de la délégation de leur pays membre du GBIF (voir la liste des pays participants), qui pourront transmettre un maximum de deux candidatures au Secrétariat du GBIF jusqu'au 15 juillet 2017. Les étudiants français peuvent contacter directement le GBIF France via le formulaire de contact.

Un jury composé de représentants du réseau GBIF, du comité scientifique du GBIF et d'experts sur les données d'écologie évalueront les jeux de données soumis sur des critères de complétude et de qualité des données, ainsi que sur les métadonnées descriptives associées.

Une fois sélectionnés, les lauréats devront préparer des data papers décrivant leurs jeux de données et les soumettre pour publication dans une revue en accès libre. Les éditions Pensoft Publishers, qui travaillent en étroite collaboration avec le GBIF pour développer le concept de data paper sur les données de biodiversité, ont accepté d'offrir les frais de publication aux lauréats pour leurs data papers soumis à la revue Biodiversity Data Journal via l'outil Arpha writing tool de Pensoft.

Le prix 2017 GBIF Young Researchers Award est financé par SBNO: Stichting ter Bevordering van Natuurwetenschappelijk Onderzoek, avec une contribution en nature de la part de Pensoft Publishers (suppression des frais de publication).

Pour plus d'informations, vous pouvez également télécharger l'appel à propositions (en anglais).

Le Canada a renouvelé récemment son engagement dans le réseau GBIF en rejoignant le groupe des Participants Votants après une pause de cinq ans. L'institution Agriculture and Agri-Food Canada (AAFC) a re-signé le Memorandum of Understanding du GBIF au nom du gouvernement canadien. En plus de l'obtention du droit de vote au Conseil d'Administration (Governing Board) du GBIF, le Canada contribuera de nouveau au budget international du réseau GBIF.

Le point nodal national du Canada, Canadian Biodiversity Information Facility, travaille en étroite collaboration avec l'organisation partenaire du GBIF Canadensys afin de coordoner un réseau national d'éditeurs de données partageant à l'heure actuelle 121 jeux de données concernant plus de 5 million d'enregistrements d'occurrences d'espèces. Si les trois-quarts de ces enregistrements sont localisés sur le territoire du Canada, 1,2 millions d'enregistrements fournissent des preuves d'occurrences d'espèces dans 230 autres pays, îles et territoires. Les utilisateurs du site GBIF.org ont accès à plus de 32 millions d'enregistrements d'espèces situés au Canada.

Plus d'informations sur cette page (en anglais).

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