Vendredi 22 Novembre 2024

GBIF

Le plus jeune pays du monde, le Soudan du Sud, a rejoint le GBIF en tant que participant associé. Grâce à la signature du Memorandum of Understanding par le ministère de l'Environnement et des Forêts représenté par le sous-secrétaire à l'environnement M. Joseph Africano Bartel, le Soudan du Sud devient le 17ème pays d'Afrique et 55ème pays à entrer dans le réseau GBIF en tant que membre national.

 

L'entrée du Soudan du Sud dans le GBIF est liée à sa participation au programme Biodiversity Information for Development (BID) financé par l'UE et géré par le GBIF. Ce programme est axé sur une meilleure mise à disposition de l'information sur la biodiversité. Il a été lancé en priorité  en Afrique subsaharienne, les Caraïbes et le Pacifique. Cela comprend le financement d'un projet visant à créer un mécanisme permettant de mobiliser des données sur la biodiversité des écosystèmes du Sud-Soudan grâce au développement du Système national de bases de données sur la biodiversité (NBDS).

 

Le directeur adjoint de la Biodiversité au ministère sud-soudanais de l'Environnement et des Forêts, et chef du projet national BID, Paul Demetry, commente:

«La participation au GBIF aidera le Soudan du Sud à respecter ses engagements envers la Convention sur la diversité biologique (CBD), à atteindre les objectifs d'Aichi et à faciliter la mise à jour régulière et l'a rédaction de rapports sur la stratégie et l'action nationales en matière de biodiversité.

 

"L'entrée du Sud-Soudan dans le GBIF coïncide avec les efforts nationaux de mobilisation de données soutenus par l'Union européenne à travers le Programme de gestion de la biodiversité (BMP) de l'Autorité intergouvernementale pour le développement (IGAD). Combinées, les deux initiatives contribueront à la mise en place d'un processus décisionnel solide dans la gestion et la conservation des ressources biologiques au Soudan du Sud et dans sa région."

 

Tim Hirsch, directeur adjoint et chef de la participation du Secrétariat du GBIF, a ajouté: " C'est formidable de voir un nouveau pays africain accorder une telle priorité à l'importance de l'information sur la biodiversité dans son développement national et nous souhaitons la bienvenu au Soudan du Sud dans notre communauté collaborative ".

GBIF.org donne accès à 58 jeux de données contenant un peu moins de 7.000 enregistrements d'occurrences marqués du code de pays ISO SS, attribué au Soudan du Sud en 2011. Un tiers d'entre eux provient du jeu de données Mammal Collection du Field Museum of Natural History de Chicago.

 

Parmi les autres sources de données sur la biodiversité sud-soudanaise, citons le Cornell Lab of Ornithology (Ensemble d'observations eBird), le Musée national d'histoire naturelle de la Smithsonian Institution et le Musée de zoologie comparée de l'Université Harvard. Des contributions supplémentaires de la Wildlife Conservation Society (WCS), de l'Université de Juba, des Herbiers Est Africains des Musées Nationaux du Kenya (NMK), du Ministère de la Conservation de la Nature et du Tourisme et du Ministère de l'Environnement et des Forêts sont attendues.

 

Lien vers la news originel (en anglais) : ici

Dessin d'une banane abyssinienne (Ensete ventricosum) au Soudan du Sud à partir de la collection de dessins botaniques de Georg Schweinfurth au Jardin Botanique et au Musée Botanique de Berlin-Dahlem. Image sous licence CC-BY-SA 3.0.

Le Musée des Confluences, partenaire du GBIF depuis octobre 2017, a récemment mis en ligne trois jeux de données provenant de ses collections naturalistes : les Rhopalocères de Martinique, les Nymphalidae Ithomiinae et une collection de Cirripèdes.

Ces jeux de données représentent un total de plus de 1700 données sur la biodiversité librement accessibles en ligne.

 

Ces nouvelles données sur les Invertébrés seront également accessibles sur le portail français du GBIF très prochainement.

 

Pour plus d'informations, vous pouvez consulter la page dédiée au Musée des Confluences sur le site du GBIF.

Au nom du réseau des participants nationaux, le Secrétariat du GBIF a le plaisir de lancer l'appel à candidature pour le Young Researchers Award 2018 (prix des jeunes chercheurs). Ce programme annuel vise à favoriser la recherche et la découverte innovantes en informatique, sur la biodiversité par des étudiants diplômés dont les études de masters et de doctorat reposent sur des données médiatisées par le GBIF.

 

Le programme 2018 offrira 5000€ comme prix, marquant la reconnaissance du travail de deux étudiants diplômés (de préférence), un candidat effectuant un Master et un autre candidat qui passe un doctorat. Ces deux étudiants seront nommés par les pays participants GBIF.

 

Les lauréats seront sélectionnés parmi le groupe de candidats dont les noms seront reçus par le Secrétariat du GBIF avant le 15 juin 2018. Les gagnants seront annoncés juste avant la 25ème réunion du Conseil d'administration du GBIF, qui se tiendra à Kilkenny, Irlande, en octobre 2018.

 

Eligibilité

Les candidats doivent être inscrits à un programme d'études supérieures pour être admissibles. Ils doivent être, soit des citoyens d'un pays participant du GBIF, soit des étudiants d'un établissement situé dans un pays participant du GBIF. La nomination peut provenir du pays de citoyenneté ou du pays de l'institution d'accueil du candidat.

 

Processus de soumission et délais

Les étudiants qui demandent une nomination doivent s'adresser au chef de délégation d'un pays votant ou associé au GBIF (voir la liste complète). Les participants nationaux sont responsables des délais et processus de réception et de traitement des candidatures qu'ils établissent. En conséquence, les étudiants des cycles supérieurs qui demandent une nomination peuvent consulter les sites Web de leurs point nodal (au GBIF) ou contacter directement le chef de délégation ou le gestionnaire de nœud.

 

Les propositions des étudiants sont d'abord examinées et priorisées au niveau national. Les nœuds nationaux du GBIF sont encouragés à travailler en étroite collaboration avec les communautés académiques et les établissements d'enseignement supérieur dans leurs pays et toucher aux programmes universitaires et groupes de recherche pertinents.

 

Les chefs des délégations nationales peuvent soumettre un maximum de deux candidatures au Secrétariat du GBIFà youngresearchersaward@GBIF.org.

 

La date limite de soumission est le 15 juin 2018.

 

Les chefs des délégations doivent s'assurer que les soumissions sont complètes et inclure tous les éléments énumérés ci-dessous. Les soumissions de propositions incomplètes ne seront pas considérées.

 

Elements nécessaires pour une proposition

Les candidats doivent préparer leurs propositions et leurs dossiers de candidature de telle sorte que les éléments cités ci-dessous soient inclus dedans :

  • un résumé de la recherche (200 mots)
  • une description du projet (maximum 5 pages, Arial 12 points) qui décrit
    • le besoin de la recherche et la(es) question(s) qu'elle aborde.
    • le rôle des données accessibles via le GBIF pour répondre à ces questions. Les propositions de recherche doivent clairement démontrer comment l'étude intègre les données mobilisées à travers le GBIF. Les étudiants ayant des questions sur les données accessible via le GBIF devraient travailler avec les conseillers académiques, leur nœud national GBIF, le Secrétariat du GBIF ou les membres du Comité scientifique pour améliorer la compréhension de ces données.
    • la portée de la recherche, le plan, les méthodologies, les références bibliographiques pertinentes et le calendrier.
    • le cas échéant, une description ou un extrait d'un plan de gestion des données décrivant comment les données relatives à la recherche sont publiées ou seront préparées pour publication à travers le réseau GBIF.
  • Budget (1 page), détaillé et justifié. REMARQUE: les éléments rentrant dans le budget sont limités aux frais d'inscription, à l'équipement essentiel, aux fournitures (matériel et logiciel, par exemple) et aux déplacements; l'aide salariale n'est pas permise.
  • Curriculum vitae du candidat étudiant, y compris les informations complètes de contact de l'institution d'origine.
  • Documents d'appui :
    • Une lettre officielle du mentor/superviseur de l'étudiant dans la faculté certifiant que le candidat est un étudiant en règle dans le programme d'études supérieures de l'université.
    • Au moins une, et pas plus de trois, lettres d'appui de chercheurs établis, actifs dans un domaine qui englobe et intègre l'informatique dans la biodiversité (ex : Génétique, composition et caractères des espèces, biogéographie, écologie, systématique, etc.)

 

Processus de sélection et critères

Le Comité scientifique du GBIF examinera les candidatures et sélectionnera les lauréats des Young Researchers Awards en septembre 2018. Les lauréats seront annoncés lors de la 25ème réunion du Conseil d'administration du GBIF en Irlande le mois suivant.

 

Les critères pour les récompenses incluent:

  • l'originalité et l'innovation
  • l'utilisation et l'importance stratégique de données accessibles via le GBIF
  • l'efficacité mesurable et son impact sur l'avancement de l'informatique dans la biodiversité et / ou la conservation de la diversité biologique
  •  
  • Les propositions qui ne sont pas sélectionnées peuvent être mises à jour et soumises à nouveau pour examen dans les années suivantes.

 

Les lauréats sont supposés reconnaître le soutien du GBIF lors de la diffusion des résultats de leurs recherches par le biais de publications évaluées par des pairs, de présentations lors de réunions professionnelles et via d'autres médias.

 

Voir l'article original (en anglais) ici

 

Plus d'information concernant le GBIF Young Researchers Award (en anglais) ici

 

 

Lézard de la clôture de l'Ouest (Sceloporus occidentalis). Photo de Sonja Braden via les observations de qualité de recherche iNaturalist, sous licence CC BY-NC 4.0.

Challenge GBIF Ebbe Nielsen 2018

Êtes-vous un champion des données ouvertes ?

 
Le Challenge Ebbe Nielsen est un concours annuel visant à inciter les utilisations novatrices et l’ajout d’applications liées à l'infrastructure ouverte de recherche sur la biodiversité soutenue par le GBIF, le Système mondial d'information sur la biodiversité.
 
Ces applications innovantes des données issues du GBIF peuvent prendre diverses formes et formats, par exemple : nouvelles recherches analytiques, représentations visuelles plus complètes pour les prises de décision politiques, applications Web et mobiles, améliorations des processus de numérisation qualité et accessibilité des données, et bien plus encore.
 
Le Challenge 2018 récompensera des avancées dans le domaine de la science ouverte, concernant des outils et des techniques qui améliorent l'accès, l'utilité ou la qualité des données issues du GBIF. La récompense s’élèvera à 34 000€.
Dans le cadre de cet appel ouvert, les soumissions peuvent s'appuyer sur des outils et fonctionnalités existants, tels que les API GBIF, l’IPT (Integrated Publishing Toolkit), le validateur de données, l’outil d’occurrences d'espèces relatives ou développer de nouvelles applications, méthodes, workflows ou analyses.
 
Les propositions gagnantes étendront et augmenteront l'utilité, l'ouverture et la visibilité des données issues du GBIF pour les groupes d'acteurs identifiés. Chaque soumission devra démontrer les avantages qu’elle apporte pour au moins trois des groupes suivants: chercheurs, décideurs, éducateurs, étudiants et sciences participatives.
 
Les gagnants seront annoncés lors de la 25ème réunion du Conseil d'administration du GBIF, à Kilkenny, en Irlande, en octobre 2018.
 

Pré-requis 

 
Les participants doivent s'assurer que leurs soumissions sont facilement accessibles via Internet pour les membres du jury du Challenge et le personnel du Secrétariat du GBIF. 
Si cette condition est remplie, les participants sont invités à documenter et présenter leurs propositions via l’un des référentiels ou site web suivant : GitHub, Dryad, FigShare, Open Science Framework, Jupyter Notebook, etc.
Quel que soit le format, les participants doivent également fournir des informations et métadonnées à propos des participations. Cela inclut le nom des participations, les membres de l'équipe contribuant au Challenge, la description, les instructions d'utilisation, les motivations de l'équipe et leur emplacement source.
 
En encourageant les participants à utiliser des outils avec lesquels ils sont à l'aise, nous espérons que toute personne qui soumettra sa présentation pourra se concentrer sur des questions essentielles (quoi, pourquoi, comment) plutôt que sur l'endroit où elle sera hébergée. Les questions essentielles étant : Qu’est ce qui constitue la soumission ? Pourquoi  est-elle importante pour la communauté du GBIF ou les communautés qu’elle est censée servir ? Comment fonctionne-t-elle ?
 

Que devrais-je soumettre ?

 
Les participations peuvent être des outils tels que des sites Web, des applications autonomes ou mobiles ou des résultats d'analyses. Elles peuvent également constituer des améliorations procédurales, notamment pour l'analyse ou la visualisation de données, les flux de données, le téléchargement ou les annotations. Si la soumission est le résultat d'une analyse, l'analyse doit être répétable, et inclure suffisamment de détails pour pouvoir effectuer sa répétition.
 
Les champs obligatoires dans le formulaire d'inscription doivent comporter :
 
Le nom de la soumission / le titre
Les noms et affiliations des membres de l'équipe
Un résumé avec une brève description en anglais d'environ 200 mots
Une documentation précise de la soumission
Une vidéo d'introduction, des captures d'écran et / ou autres éléments visuels qui illustrent ou décrivent la soumission
 
Les soumissions basées en grande partie ou entièrement sur des travaux déjà publiés ne sont pas considérées comme des participations admissibles.
 

Egibilité

 
Le Challenge est ouvert aux individus, aux équipes de particuliers, aux entreprises (et à leurs employés), ainsi qu'aux agences gouvernementales (et à leurs employés). Les personnes faisant partie d’une équipe doivent sélectionner un délégué qui représentera et agira au nom de l’équipe. Ce représentant servira de point de contact principal entre l'équipe et le GBIF pour assumer tous les droits et responsabilités concernant le Challenge. Si une participation provenant d’une équipe est sélectionnée comme gagnante, le GBIF versera l'intégralité du prix au représentant de celle-ci. A la charge du représentant de distribuer ensuite l'argent du prix aux autres membres de l'équipe.
 
Sont exclus du Challenge :
 
Les membres du Secrétariat du GBIF
Les particuliers actuellement sous contrat externe délivré par le Secrétariat du GBIF
Les membres du comité scientifique du GBIF
Les chefs de délégation au GBIF
 

Date limite pour les soumissions

 
Les personnes ou équipes intéressées peuvent soumettre leur(s) contribution(s) à partir du 9 mai 2018 via la page de soumission du challenge Ebbe Nielsen
 
Les inscriptions doivent être reçues au plus tard le mercredi 5 septembre 2018 à 16h00 (heure Paris)
 

Critères

 
Un jury composé d'experts des domaines scientifiques, informatiques et technologiques pertinents évaluera les soumissions en fonction des critères suivants:
 
Ouverture et réitération : les éléments constitutifs de la soumission, comme le code et le contenu, sont-ils librement disponibles et transparents ? Ont-ils les autorisations adéquates ?
Applicabilité : La soumission a-t-elle une pertinence et une portée suffisantes pour que les communautés du GBIF puissent l’utiliser ou la mettre en place ?
 Nouveauté : Une partie significative de la soumission a-t-elle été développée spécifiquement pour le challenge ? 
 

Contexte

 
Le Challenge Ebbe Nielsen honore la mémoire du Dr. Ebbe Schmidt Nielsen, un leader inspirant dans les domaines de la biosystématique et de l'informatique sur la biodiversité. Il fut l'un des principaux fondateurs du GBIF, et est mort tragiquement juste avant la naissance de celui-ci.
 

Sponsor

 
Le Challenge 2018 est financé en partie grâce au soutien du Conseil suédois de la recherche.
 
Plus d’information (en anglais) : ici
Le CESAB (CEntre de Synthèse et d'Analyse sur la Biodiversité) organise un séminaire à Paris, à l'amphithéatre de l'INRA (147 Rue de l’université), le 11 avril, en anglais de 13h à 17h.
 
Ce séminaire est l'occasion de réfléchir à la manière dont nous développons les bases de données et les connaissances nécessaires pour comprendre notre planète. Les présentations, suivies d'une table ronde, examineront: 
- comment l'entreprise scientifique évolue et comment les données «anciennes» et «nouvelles» sont essentielles pour améliorer nos connaissances; 
- comment les données sont intégrées globalement et à travers les disciplines scientifiques pour comprendre et soutenir les écosystèmes de notre planète;
- comment les approches novatrices des technologies de l'information aident à créer une nouvelle compréhension de la biodiversité de la Terre;
- comment nous transformons la biodiversité et les mesures écologiques en information pouvant être exploitée par les scientifiques, les gestionnaires de ressources et les décideurs.
 
Les discussions porteront sur la façon dont la science évolue, sur les nouvelles initiatives de recherche et de données internationales et sur la meilleure façon d'identifier, de collecter et de partager des données pouvant être rapidement assimilées et utilisées pour comprendre et sauver notre planète.
 
Seront présent : Bill Michener (DataONE), Simon Hodson (CoData), Donald Hobern (GBIF) et Dirk Schmeller (UFZ).
 
Le séminaire se déroulera exclusivment en anglais !
 
 
Inscription pour cet événement : ici.
 
Plus d’information (en français): ici
 
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