Lundi 23 Décembre 2024

Octobre 2023

Les prix récompensent les réalisations d'excellence et d'innovation au sein de la communauté mondiale des nœuds du GBIF

 

Les nœuds GBIF de Colombie et des Pays-Bas sont les premiers récipiendaires des nouveaux GBIF Node Awards. Le programme de prix honorera les réalisations collectives des équipes qui coordonnent les activités liées au GBIF pour les pays et organisations participants du réseau.

SiB Colombie a reçu le prix d'excellence, célébrant ses progrès dans une gamme de domaines de services critiques pour les nœuds du GBIF, tels que le soutien scientifique et politique, l'engagement communautaire et l'aide technique pour la gestion des données sur la biodiversité.

NLBIF a remporté le « Global Impact Award », qui reconnaît la valeur de son initiative sur le rapport de développement durable des entreprises de l'UE pour contribuer à la fois à la mise en œuvre du cadre stratégique du GBIF et à ses avantages potentiels et son applicabilité pour l'ensemble du réseau GBIF.

Les GBIF Node Awards auront lieu tous les deux ans dans le but de mettre en lumière des approches exemplaires pouvant inspirer d'autres nœuds à entreprendre des actions similaires. La première année du programme a reçu des nominations de haute qualité dans les deux catégories. Le personnel du Secrétariat réutilisera les exemples inclus dans les candidatures en tant qu'exemples directeurs reproductibles pour faire progresser davantage l'accès et l'utilisation des données gratuites et ouvertes sur la biodiversité.

 

« Ces prix mettent en lumière le dévouement et l'ingéniosité exceptionnels de notre communauté de nœuds, et SiB Colombie et NLBIF sont des avant-gardistes qui inspirent d'autres à emboîter le pas », a déclaré Mélianie Raymond, responsable de la communauté et des capacités au Secrétariat du GBIF. « Nous sommes impatients de voir comment leurs réalisations, ainsi que celles partagées dans toutes les autres nominations exceptionnelles, peuvent catalyser de nouvelles innovations à travers le réseau. »

 

Prix d'excellence : SiB Colombie

Pour son dévouement inébranlable à la mobilisation de données sur la biodiversité et ses contributions constantes à l'avancement des objectifs stratégiques globaux du GBIF, tant au niveau national que dans la région Amérique latine et Caraïbes, le jury a décerné le premier Prix d'excellence des nœuds GBIF à SiB Colombie. . La sélection reconnaît plusieurs des réalisations de l'équipe, notamment :

  • Une application inspirée du service de portail hébergé du GBIF, qui exploite les capacités de la plateforme pour intégrer une gamme diversifiée d'outils et de produits sur biodiversidad.co
  • Les avancées du réseau Biodiversidad y Desarrollo, une collaboration avec des partenaires clés du secteur des affaires du pays qui intègre un corpus croissant de données ouvertes sur la biodiversité provenant d'évaluations d'impact environnemental (actuellement plus de trois millions d'enregistrements d'occurrences )
  • Une stratégie de formation qui a assuré une transmission efficace des connaissances, à la fois pour les programmes virtuels et en personne, tout en améliorant l'accessibilité et en favorisant l'inclusion au sein des communautés hispanophones en dirigeant la traduction de supports techniques en espagnol
  • Un programme de stages qui a permis de publier plus de 300 000 enregistrements marins, d'améliorer la qualité de jeux de données historiques et de créer une cohorte nouvellement formée à l'aide des licences DataCamp acquises via le Data Use Club du GBIF

 

« Les efforts collectifs de l'équipe et leur dévouement à répondre aux besoins et aux défis de notre communauté ont encouragé notre réseau à reconnaître les avantages de progresser vers la démocratisation des connaissances sur notre biodiversité », a déclaré Ricardo Ortiz, gestionnaire de nœud pour SiB Colombie, qui est hébergé à l'Institut Humboldt (Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt) à Bogotá. « C'est également une reconnaissance des efforts du réseau SiB Colombie de plus de 200 éditeurs, dont l'engagement en faveur des données ouvertes est la pierre angulaire pour contribuer de manière significative à la réalisation des objectifs nationaux et mondiaux. »

 

Équipe du nœud SiB Colombia

  • Dairo Escobar : Gestionnaire de nœud (janvier 2020-juin 2023) ; Chef de délégation (mai 2015-janvier 2020) ; Personnel du nœud (avril 2012-juin 2023)
  • Camila Plata : Personnel du nœud (2013-2015, 2018-février 2023)
  • Ricardo Ortiz : Gestionnaire de nœud (juin 2023-présent); Personnel du nœud (2018-juin 2023)
  • Esteban Marentes : Personnel du nœud (2020-présent)
  • Jeimmy Diaz : Personnel du nœud (2018-mars 2023)
  • Andres Duarte : Personnel du nœud (2021-)

 

Prix de l'impact mondial : NLBIF

Avec l'entrée en vigueur de la Directive sur les rapports de développement durable des entreprises (CSRD) en janvier 2023 dans le cadre du Pacte vert pour l'Europe, les entreprises européennes ont un besoin urgent de comprendre comment préparer et publier de nouveaux rapports environnementaux à partir de 2025. En reconnaissance d'un projet pilote pionnier avec le cabinet comptable Big Four KPMG pour aider à développer un flux d'analyse afin d'évaluer les dépendances des entreprises et leurs impacts sur la biodiversité, le jury a sélectionné NLBIF, le nœud national GBIF pour les Pays-Bas, comme le récipiendaire du premier Prix des noeuds GBIF pour l'innovation.

Les entreprises sont confrontées à des demandes croissantes de divulgation de leurs dépendances, impacts, risques et opportunités liés à la nature, non seulement en Europe, mais dans le monde entier. La capacité unique du GBIF à fournir des données à l'échelle mondiale et spécifiques à un emplacement sur les modèles et les caractéristiques de la biodiversité a suscité un intérêt croissant des entreprises, notamment la participation du Secrétariat à une récente étude exploratoire sur les besoins en données sur la biodiversité du secteur des entreprises menée par le Taskforce for Nature-based Financial Disclosures (TNFD). En initiant un échange de connaissances plus approfondi entre les entreprises et les experts en biodiversité, le partenariat du NLBIF avec KPMG a fait progresser de nouvelles opportunités politiques pour l'utilisation des données médiatisées par le GBIF qui peuvent instruire et bénéficier à tous les nœuds du GBIF.

 

« Aider les entreprises à rendre compte de leurs impacts et de leur dépendance à l'égard de la nature et de la biodiversité dans le cadre du CSRD en utilisant des informations géospatiales et temporelles sur la biodiversité dérivées des données médiatisées par le GBIF présente un potentiel important pour accroître notre impact », a déclaré Niels Raes, gestionnaire de nœud NLBIF et responsable de programme au Naturalis Biodiversity Center, l'institution hôte du NLBIF. « Avec une grande partie de la couverture terrestre mondiale sous contrôle privé, nous devons garantir une mise en œuvre efficace du CSRD et du TNFD pour guider le développement durable vers les objectifs du Cadre Mondial pour la Biodiversité. »

 

Équipe du nœud NLBIF

  • Niels Raes : Gestionnaire de nœud
  • Jeroen Creuwels : Gestionnaire de données
  • Amy van Nobelen : Chargée de communication
  • Sijmen Cozijnsen : Soutien technique

 

Équipe du SiB Colombia, mars 2022 : Dairo Escobar, Esteban Marentes, Ricardo Ortiz, Camila Plata, Jeimmy Díaz et Andrés Duarte. Photo par Dario Escobar

 

Lire l'article original

 

Le système de notification des occurrences d'espèces ouvre la voie, avec des améliorations Frictionless Data vers Bionomia gagnant la deuxième place et la troisième place partagées par Library Identification Resources et Open Data Biodiversity Mapper

GBIF Alert, un système open-source flexible pour informer les utilisateurs de la disponibilité d'enregistrements de nouvelles occurrences via GBIF, a gagné la sélection en tant que premier lauréat du Défit GBIF Ebbe Nielsen 2023.

Les membres de l'équipe belge responsable de GBIF Alert, dirigée par Nicolas Noé de The Binary Forest, ne sont pas étrangers à la communauté GBIF ou au podium des vainqueurs du Défi. Noé faisait partie d'une équipe à trois personnes qui a gagné le prix inaugural du Défi en 2015 avec Peter Desmet de l' Institut de recherchepour la nature et la forêt (INBO), qui l'a rejoint à nouveau ici. Lien Reyserhove et Damiano Oldoni d'INBO ont également collaboré avec Desmet sur leur entrée commune en première place en 2018. Les collègues d’INBO Tim Adriaens et Bram D’Hondt complètent les membres de l’équipe gagnante de cette année.

Frictionless Data from Bionomia, soumis par David Shorthouse, a remporté le deuxième prix pour une nouvelle fonctionnalité d'exportation qui prend en charge l'amélioration continue de la qualité des données pour les enregistrements de spécimens issus de collections scientifiques. Deux candidatures qui se partageront la troisième place complètent la liste des gagnants de 2023 :

 

Le jury, présidé par Birgitte Gemeinholzer, professeur de botanique à l'Université de Kassel et actuelle présidente du Comité scientifique du GBIF, a sélectionné les gagnants du Challenge de cette année parmi un groupe de 12 candidatures qualifiées. Ce prix incitatif annuel honore la mémoire du Dr Ebbe Schmidt Nielsen, un entomologiste dano-australien qui fut l'un des principaux fondateurs du GBIF et un leader inspirant dans la communauté de la biosystématique et de l'informatique de la biodiversité.

Les allocations de la cagnotte annuelle de 20 000 € permettent d'attribuer 8 000 € à l'équipe à la première place, 6 000 € pour la deuxième place et 3 000 € pour chacune des équipes gagnantes à la troisième place.

 


 

Gagnants du GBIF Ebbe Nielsen Challenge 2023

Premier prix
GBIF Alert : un système d'alerte open source pour les occurrences basé sur le GBIF

Cet outil open source réutilisable montre comment utiliser GBIF.org comme système pour informer les utilisateurs des enregistrements d'occurrence nouvellement disponibles pour toute espèce ou lieu d'intérêt. Bien qu'il puisse être déployé et configuré pour générer des alertes pour toute combinaison de taxons, de zones ou d'ensembles de données sources spécifiques, le cas d'utilisation le plus probable du système se concentre sur la gestion des espèces exotiques envahissantes (EEE).

Les gestionnaires de terrain et les décideurs politiques chargés de surveiller la propagation des EEE ont besoin d'un accès rapide aux informations sur l'apparition de nouvelles occurrences d'espèces préoccupantes, que ce soit dans des zones d'introduction connues ou dans de nouvelles zones. GBIF Alert peut les tenir informés des nouveaux enregistrements (ou nouveaux pour le GBIF) de leurs espèces d'intérêt, déclenchant l'envoi de notifications à une adresse courriel sélectionnée via une interface utilisateur simple et intuitive. La démo soumise pour le défi est configurée pour surveiller l'index d'occurrence du GBIF pour les nouveaux enregistrements d'espèces envahissantes en Amérique du Nord.

 

« GBIF Alert est né directement de l'expérience du développement de Life RIPARIAS, un système d'alerte précoce open source basé sur le GBIF ciblant certaines plantes riveraines et les écrevisses envahissantes dans certaines régions de Belgique. Une fois que nous avons réalisé qu’une configuration plus flexible et moins codée en dur la rendrait utile à de nombreuses autres équipes à travers le monde, il nous a semblé mal de la garder pour nous et nous avons donc poussé notre effort un peu plus loin. » dit Noé. « Notre bonheur et notre surprise d'avoir remporté le premier prix nous ont donné l'impulsion nécessaire pour investir dans d'autres outils en informatique sur la biodiversité dans le même esprit open source, et nous aimerions voir la fonctionnalité de GBIF Alert intégrée directement dans GBIF.org. »

 

vidéo | GitHub | Démo GBIF Alert pour les espèces invasives aux États-Unis

 

Deuxième prix
Frictionless Data from Bionomia

Cette participation préparée par l'informaticien canadien de la biodiversité David Shorthouse est la seule gagnante du deuxième prix du Défi 2023. Bionomie, la plate-forme qu'il a publiée pour la première fois il y a cinq ans, tire parti des identifiants persistants d'ORCID et de Wikidata pour permettre aux « scribes » volontaires d'annoter les enregistrements de spécimens partagés sur le GBIF.org, clarifiant les crédits qu'ils donnent aux collecteurs de spécimens individuels et aux identifiants. Au cours du processus, cela a suscité des discussions plus larges sur une meilleure reconnaissance et récompense de l'expertise nécessaire à l'assemblage, la maintenance, la numérisation et la conservation des connaissances sur les collections scientifiques du monde.

La participation au Défi 2023 de Shorthouse a décrit une nouvelle fonctionnalité qui prépare automatiquement lesFrictionless Data Packages de collecteurs et d'attributions d'identifiants dans Bionomia pour chaque jeu de données. En s'appuyant sur cette simplicité d'un format pratique cela permet à un gestionnaire de collections d'importer plus facilement des attributions Bionomia dans un système de gestion de collections local et de partager des enregistrements récemment mis à jour et améliorés, créant ainsi un cycle vertueux d'"aller-retour" d'améliorations de la qualité des données.

La sélection de Bionomia par le jury met en lumière la valeur de la création de nouvelles fonctionnalités dans les outils existants. En attendant, le gestrionnaires de données, qui améliorent actuellement la qualité des données de leurs collections avecnles attributions de Bionomia vont partager les pointeurs et les leçons apprises le 6 décembre 2023 lors d'un atelier en ligne en allez-retour, pour lequel les inscriptions sont à présent ouvertes.

 

"Ces nouveaux résultats aident à démontrer la valeur institutionnelle de Bionomia et offrent un retour sur investissements positif pour la numérisation et la transcription de spécimens, a dit Shorthouse. "Des identifiants uniques persistants pour les personnes peuvent sembler légers à hériter, mais ils servent de passeports à la provenance, des microhistoires et des fils émotifs qui relient les personnes qui ont jeté les bases de nos collections d'histoire naturelle à leurs réseaux de soutien. ce qu'ils ont collecté, où ils étaient, et notre planète partagée. J'espère que toutes les collections qui partagent des données sur le GBIF pourront utiliser le service aller-retour de Bionomia pour aider à renforcer leurs propres réseaux locaux. »

 

vidéo | GitHub

 

Troisième prix
Bibliothèque des ressources d'identification

Cette plateforme Web développée par le biologiste et programmeur Lars Willighagen combine deux services Web qui guident les scientifiques amateurs vers des clés taxonomiques appropriées pour les aider à identifier les organismes qu'ils observent eux-mêmes. Willighagen est actuellement inscrit en tant qu'étudiant en maîtrise à l'Institut Radboud pour les sciences biologiques et environnementales (RIBES) de l'Université Radboud à Nimègue, aux Pays-Bas.

Un catalogue de références taxonomiques du domaine public lisible par des machines allant des simples guides picturaux aux publications en série complètes fournit le premier service sous-jacent. Ce référentiel bibliographique contient des métadonnées sur les ouvrages de référence et des informations sur leur portée et leur exhaustivité taxonomique et géographique. Dans la mesure du possible, la liste complète des noms apparaissant dans les œuvres est extraite et mappée à l'ossature taxonomique du GBIF à l’aide de l’API GBIF.

Les utilisateurs utilisent le deuxième service plus visible en entrant l'emplacement et le nom scientifique d'une observation qui a besoin d'être identifiée. Les résultats de la recherche renvoient des publications de référence potentiellement pertinentes dans le catalogue et des estimations de leur utilité dans la vérification de l'identification de l'observation. Les estimations d'admissibilité reposent sur l'API GBIF pour établir une liste de contrôle de toutes les espèces trouvées à l'emplacement de la recherche géographique, qui peuvent être comparées aux listes de taxons des publications. L'utilisation des données disponibles tient compte des changements dans la répartition des espèces au fil du temps, étant donné que les clés plus anciennes centrées sur des taxons spécifiques provenant des régions cibles peuvent devenir inadaptées tandis que d'autres se limitant à différentes régions sont devenues appropriées.

vidéo | Trouver des ressources d'identification | Catalogue | GitHub : Recherche de ressources | GitHub : Catalogue

 

Troisième prix
Open Data Biodiversity Mapper

Le prototype basé sur R Shiny webapp construit par Sam Perrin, Philip Stanley Mostert et Ron Togunov de NTNU exécute un flux de données open-source qui prétraite différents types de jeux de données, permettant aux utilisateurs de produire plus facilement des modèles intégrés de distribution d'espèces (MIS).

Cette approche reconnaît que, malgré les avantages de la standardisation, les observations opportunistes de la part de scientifiques citoyens, par exemple, diffèrent considérablement des enregistrements recueillis en utilisant un protocole complexe pour l'échantillonnage de l'abondance. En préservant certaines des poiints forts et caractéristiques uniques des méthodes contrastantes de collecte dans les jeux de données sous-jacents et en les intégrant dans un seul cadre statistique – plutôt que de simplement regrouper les enregistrements et aplanir leurs différences – le Mapper Open Data Biodiversity améliore les visualisations ISDM qui en résultent.

L'outil génère actuellement des cartes d'intensité des espèces pour quatre groupes taxinomiques différents dans le comté de Trøndelag en Norvège centrale, mais l'équipe met actuellement à l'échelle l'outil pour produire des cartes pour toute la Norvège. Bien qu'il soit prévu de rendre l'approche ISDM accessible aux groupes sans les compétences nécessaires à la lutte des données l'accès aux scripts et les instructions étape par étape pour les utiliser devraient permettre aux utilisateurs ayant une certaine connaissance de GitHub, GBIF et R pour créer des versions localisées de l'outil pour d'autres taxons cibles.

video | GitHub

 


 

Jury du Challenge Ebbe Nielsen 2023

 

Illustration d'une limule japonaise Tachypleus tridentatus(Leach, 1819) from Fauna japonica v.1 Crustacea (1823-1830) via Biodiversity Heritage Library, sous licence domaine public CC0.

 

Lire l'article original

Date limite pour les commentaires et commentaires de la communauté : mardi 31 octobre 2023

 

Le GBIF a publié un nouveau document technique pour examen par les pairs de la communauté. Le guide, Meilleures pratiques pour la gestion et la publication des données de pièges photographiques, est désormais ouvert à la contribution et aux commentaires des membres de la communauté jusqu'au mardi 31 octobre 2023.

 

Le Secrétariat du GBIF a chargé Lien Reyserhove, Ben Norton et Peter Desmet de préparer le guide, qui fournit des lignes directrices à jour axées sur la gestion et la publication des données provenant des pièges photographiques.

Les pièges photographiques sont devenus des outils importants pour surveiller l’état de la biodiversité et des écosystèmes naturels. La prolifération des données provenant de ces capteurs a fait de la gestion des données, plutôt que de la collecte de données, le facteur limitant de la recherche sur les pièges photographiques. En réponse à cela et à d'autres développements récents de la communauté, ce guide fournit des lignes directrices à jour qui optimisent la gestion et la publication des données par toute personne menant une étude par piège photographique, en particulier les gestionnaires de données, les éditeurs de données, les gestionnaires de bases de données et d'informations et les étudiants travaillant avec l'informatique de la biodiversité.

Cette version est la prochaine d'une série de guides de documentation numérique prise en charge par le GBIF. Les commentaires sur le processus d'évaluation par les pairs de la communauté et le programme de documentation numérique, y compris les suggestions sur d'autres sujets que nous devrions envisager d'aborder, sont toujours les bienvenus via communication@gbif.org. Les commentaires fournis par les membres de la communauté au cours de cette phase d'examen par les pairs élargiront encore la liste des contributeurs.

 

Comment participer à l'évaluation communautaire par les pairs ?

Les membres de la communauté souhaitant contribuer à ce processus d'évaluation par les pairs peuvent lire l'aperçu du programme de documentation numérique pour placer leurs efforts dans leur contexte, puis consulter les instructions et attentes spécifiques sur la manière de proposer des suggestions et des améliorations.

Pour prêter votre voix et participer en tant que réviseur, nous demandons aux membres de la communauté de :

 

N'oubliez pas que toutes les interactions au sein de ce processus doivent adhérer au Code de conduite du GBIF , qui vise à encourager un « environnement sûr, hospitalier et productif » qui soit « professionnel, respectueux et sans harcèlement pour tous les participants ».

 

Comment puis-je être informé de la sortie de nouveaux documents ?

Que vous soyez abonné ou non à d'autres listes du GBIF, la meilleure façon de rester informé des prochaines versions est de vous inscrire à la liste de diffusion « documentation numérique » du GBIF.. Vous pouvez également vous attendre à voir des annonces sur les réseaux sociaux du GBIF.

 

Lire l'article original

Un nouveau groupe de travail du GBIF répondra au besoin urgent d'un meilleur accès à de meilleures données et informations sur les espèces exotiques envahissantes en réponse à l'évaluation historique des espèces exotiques envahissantes approuvée par la Plateforme intergouvernementale sur la biodiversité et les services écosystémiques (IPBES) ce mois-ci.

Parmi ses conclusions, l'évaluation thématique de l'IPBES sur les espèces exotiques envahissantes et leur contrôle a conclu que le soutien aux systèmes d'information, aux infrastructures et au partage de données était l'une des sept actions stratégiques complémentaires qui pourraient permettre de réaliser des progrès ambitieux en matière de gestion, de prévention et de contrôle des invasions biologiques.

 

Les mesures stratégiques visant à prévenir l'introduction et l'impact des espèces exotiques envahissantes comprennent : Soutenir les systèmes d'information, les infrastructures et le partage de données. (§D25)

 

Le rapport identifie également le rôle essentiel que des systèmes d'information ouverts et interopérables peuvent jouer dans la compréhension des invasions biologiques, soutenus par la coopération internationale et la mise en réseau des gouvernements et des parties prenantes.

 

Le renforcement des systèmes d’information ouverts existants peut faciliter la gestion des invasions biologiques, y compris la priorisation des actions, la détection précoce et la réponse rapide, et améliorer l’efficacité des réglementations. Les systèmes d’information ouverts peuvent réduire considérablement les coûts de gestion en garantissant des réponses ciblées et appropriées, en évitant la duplication des efforts et en facilitant l’évaluation de l’efficacité des instruments politiques au moyen d’indicateurs... Ils peuvent également améliorer la disponibilité des données et des connaissances dans les régions géographiques et les habitats. et groupes taxonomiques et réduire la grande variation de la capacité de réponse. Grâce à la science citoyenne, les systèmes d’information ont le potentiel d’impliquer les gens, de les sensibiliser et d’accroître la disponibilité des données. (§D31)

 

L'évaluation a également identifié les lacunes de données les plus importantes relatives aux espèces exotiques envahissantes, « qui, si elles étaient comblées, renforceraient la compréhension des invasions biologiques& » dans les écosystèmes marins, tropicaux et polaires ; parmi les micro-organismes et les invertébrés ; ainsi que des lacunes en matière de données régionales, en particulier en Afrique et en Asie centrale. (Table SPM.A1)

 

Le groupe de travail recommandé par le Comité scientifique du GBIF, et approuvé par le Comité exécutif du GBIF examinera les développements récents dans l'interface science-politique relative aux espèces exotiques envahissantes et recommandera des actions pour le GBIF qui répondront au mieux aux besoins des utilisateurs de données. Ces développements incluent non seulement l'évaluation de l'IPBES, mais également la nécessité pour les gouvernements de suivre les progrès vers l'objectif 6 du Cadre mondial pour la biodiversité Kunming-Montréal (GBF), relatif à la prévention ou à la réduction de l'introduction et de l'établissement d'espèces exotiques envahissantes.

 

Panneau d'avertissement de biosécurité agricole à la porte d'une ferme dans le comté de Kerry, en Irlande. Photo de Gabriel12/Shutterstock, gracieuseté de l'équipe média de l'IPBES.

 

« L’évaluation de l’IPBES a souligné la nécessité essentielle de systèmes de données robustes et durables en libre accès pour soutenir les actions nécessaires à la réduction des énormes impacts des invasions biologiques sur la biodiversité, les personnes et les économies. Le GBIF est idéalement placé pour répondre à ce besoin, en travaillant en partenariat avec les communautés d'experts concernées tout en s'appuyant sur son éventail inégalé d'institutions de partage de données, y compris des groupes scientifiques citoyens », a déclaré le Dr Melodie McGeoch, professeur de sciences de la vie à l'Université de La Trobe, vice-président du comité scientifique du GBIF et auteur principal coordonnateur de l'évaluation IPBES. « Ce nouveau groupe de travail aidera à identifier les mesures pragmatiques qui peuvent être prises rapidement pour garantir que le GBIF réalise tout son potentiel en tant que ressource d'information dans ce domaine, notamment en comblant les lacunes en matière de données identifiées dans l'évaluation de l'IPBES. »

 

« Le comité scientifique du GBIF a considéré les espèces envahissantes comme un domaine qui justifiait déjà une attention prioritaire dans la période à venir, et l'évaluation de l'IPBES a encore renforcé ce point de vue », a déclaré le DR Birgit Gemeinholzer, présidente du comité et professeur de botanique à l'Université de Kassel. « Nous sommes convaincus que le nouveau groupe de travail s’appuiera efficacement sur le travail déjà réalisé pour ancrer le GBIF en tant que point de référence majeur pour la recherche et la politique dans le domaine de la biologie des invasions. »

 

« Il est clair que la question des espèces exotiques envahissantes fait partie des priorités stratégiques du GBIF, car elle démontre l'importance de notre réseau et de nos infrastructures pour relever les grands défis mondiaux », a déclaré le Dr Liam Lysaght, directeur du Centre national irlandais de données sur la biodiversité président du Conseil d'administration du GBIF : « Nous savons que les données circulant via le GBIF fournissent déjà un ensemble irremplaçable de preuves sur les espèces exotiques envahissantes, mais nous savons également que nous pouvons faire encore mieux – et c'est là que le groupe de travail peut aider. »

 

Le sujet des espèces exotiques envahissantes représente près de 14 pour cent des utilisations publiées des données du réseau GBIF, évaluées par des pairs, avec près de 1 300 articles relatifs aux espèces envahissantes enregistrés dans les archives de recherche activées par le GBIF compilées grâce à son programme de suivi des publications.

 

Le nouveau groupe de travail s'appuiera sur les travaux d'un précédent groupe d'experts responsable du rapport de 2016, Data fitness for use in research on alien and invasive species. En plus de synthétiser les développements récents et leur pertinence pour le GBIF, le nouveau groupe appliquera un cas d'utilisation sur les espèces exotiques envahissantes dans le cadre du nouveau modèle de données du GBIF et examinera l'avenir du partenariat entre le GBIF et le Registre mondial des espèces introduites et envahissantes. GRIIS, un projet du Groupe de spécialistes des espèces envahissantes de la Commission pour la sauvegarde des espèces de l'UICN.

Le GRIIS publie plus de 380 listes de contrôle d'espèces introduites et envahissantes relatives aux pays, aux îles et aux zones protégées au GBIF, et leur intégration dans l'infrastructure du GBIF permet l'inclusion d'informations sur les aires de répartition introduites et le statut envahissant sur les pages d'espèces du GBIF.org. Ces informations alimentent également les profils de pays pour le Mécanisme d'échange d'informations de la Convention des Nations Unies sur la diversité biologique (CBD).

Les listes de contrôle GRIIS, combinées aux enregistrements d'occurrences du réseau du GBIF composé de plus de 2 100 institutions publiant des données, ont fourni aux auteurs de l'évaluation de l'IPBES un cadre pour analyser l'état et les tendances des espèces exotiques envahissantes, démontrant l'un des rôles essentiels que joue le GBIF dans la réalisation des objectifs sous-jacents. preuves qui informent le GBIF.


 

En savoir plus

IPBES (2023) Résumé à l'intention des décideurs politiques du rapport d'évaluation thématique sur les espèces exotiques envahissantes et leur contrôle de la plateforme intergouvernementale scientifique et politique sur la biodiversité et les services écosystémiques. Roy HE, Pauchard A, Stoett P, Renard Truong T, Bacher S, Galil BS, Hulme PE, Ikeda T, Sankaran KV, McGeoch MA, Meyerson LA, Nuñez MA, Ordonez A, Rahlao SJ, Schwindt E, Seebens H, Sheppard AW et Vandvik V, éd. Bonn, Allemagne : Secrétariat de l'IPBES. https://doi.org/10.5281/zenodo.7430692

 

Poisson-lion (Pterois volitans), observé aux Bahamas, où il est enregistré comme envahissant dans le Registre mondial des espèces introduites et envahissantes. Photo 2023 Paige Winter via iNaturalist Research-grade Observations , sous licence CC BY-NC 4.0.

 

Lire l'article original

Étudiante en maitrise de l'université de Makarere, elle devient le premier récipiendaire de l'Ouganda - et la deuxième en Afrique - à obtenir une sélection pour améliorer la connaissance et la compréhension des espèces de poissons indigènes du pays

Dorothy Akoth, une étudiante en Maîtrise au Collège des sciences naturelles à l'Université de Makarere en Ouganda, a été nommée l'une des deux lauréats du Prix des chercheurs diplômés du GBIF.

Un jury d'experts a sélectionné Akoth, qui a été nommée par le Conseil national ougandais pour la science et la technologie en collaboration avec l'Institut national de recherche sur les ressources halieutiques (NaFIRRI), pour le rôle déterminant de ses recherches dans l'amélioration des connaissances sur la répartition et le statut de péril de 110 espèces de poissons indigènes en dehors de la tribu emblématique des Haplochromines faisant partie des cichlidés d'Afrique de l'Est.

Alors qu'Akoth terminait son programme de premier cycle au Département de zoologie, d'entomologie et des sciences halieutiques de Makarere, elle a été initiée au GBIF grâce à un projet dirigé par NaFIRRI soutenu par le programme Information sur la biodiversité pour le développement (BID) financé par l'Union européenne. Son intérêt pour le projet a motivé sa sélection pour un programme de mentorat financé par la Fondation JRS pour la Biodiversité, ce qui a permis de perfectionner ses compétences en gestion de données.

Ces expériences ont préparé le terrain pour les recherches d'Akoth, qui se sont appuyées sur une utilisation intensive des données médiatisées par le GBIF. Suite à la publication d'un article scientifique mettant à jour les cartes de répartition nationales et examinant les lacunes dans les données sur les poissons autres que Haplochromis, elle a finalisé l'application des critères de la Liste rouge de l'UICN au groupe (actuellement en préimpression).

 

« Mes recherches se sont principalement appuyées sur les données du GBIF pour mettre à jour les répartitions et évaluer les risques d'extinction, produisant ainsi la toute première Liste rouge nationale des poissons du pays », a déclaré Akoth. « Je suis honorée de recevoir ce prix pour sa reconnaissance de l'importance de mon travail. C'est aussi une excellente opportunité d'évolution de carrière et une motivation pour moi de travailler plus dur et de contribuer à la conservation de la biodiversité. »

 

« Dorothy est enthousiaste et très motivée et ses réalisations en tant qu'étudiante à la maîtrise sont extraordinaires : son article en tant que premier auteur fournit la mise à jour la plus complète sur la répartition des poissons en Ouganda depuis les travaux fondateurs de P.H. Greenwood dans les années 1960 », a déclaré Vianny Natugonza, auparavant chargé de recherche au NaFIRRI et aujourd'hui chef du Département des sciences biophysiques et de géoinformation à l'Université de Busitema. « Entre-temps, son travail sur la Liste rouge nationale contribuera à éclairer la conservation, à façonner les zones protégées, à stimuler la collecte de données et à contribuer aux évaluations régionales et mondiales de la Liste rouge de l'UICN. »

 

« Les cartes produites par Dorothy sont d'une importance cruciale pour la prise de décision en matière de conservation en eau douce en Ouganda", a déclaré Laban Muzinguzi, chercheur en biologie et écologie des poissons au NaFIRRI, éditeur du Portail sur la biodiversité en eau douce pour l'Ouganda et membre de l'équipe de soutien régionale du GBIF pour l'Afrique. « Ses recherches démontrent clairement la valeur des données ouvertes sur la biodiversité, ce qui, je l'espère, incitera davantage d'étudiants, en Ouganda et ailleurs, à publier et à utiliser des données via le GBIF. »

 

Akoth est la deuxième étudiante africaine à remporter ce prix et la première depuis 2015, lorsque Fatima-Parker Allie d'Afrique du Sud a remporté cet honneur. Le Dr Parker-Allie est désormais directrice adjointe du "Biodiversity Informatics Partnerships and Cooperation" et responsable du nœud national du GBIF au Centre sud-africain d'information sur la biodiversité (SANBI).

Akoth partage le prix 2023 avec André Vicente Liz de CIBIO au Portugal, les deux gagnants recevant un prix de 5 000 €.

 


 

À propos du Prix

Depuis sa création en 2010, le prix annuel GBIF Graduate Researchers Award (précédemment le Young Researchers Award) a cherché à promouvoir et à encourager l'innovation en recherche lié à la biodiversité utilisant des données partagées via le href="https://www.gbif.org/fr/the-gbif-network">réseau GBIF.

 

À propos de l'université de Makarere

Créée en 1922 en tant qu’humble école technique, l’Université Makerere est l’une des universités les plus anciennes et les plus prestigieuses d’Afrique. En 1970, Makerere est devenue une université nationale indépendante de la République d'Ouganda, proposant des cours de premier cycle et cycles supérieurs menant à ses propres diplômes. Aujourd'hui, Mak est un centre de recherche actif qui propose des programmes d'études de jour, de soir et externes à un corps étudiant d'environ 35 000 étudiants de premier cycle et 3 000 étudiants de cycles supérieurs provenant d'Ouganda et de l'étranger.
En savoir plus.

 

À propos de l'Institut national de recherche sur les ressources halieutiques

NaFIRRI est l'un des sept instituts nationaux publics de recherche agricole (NARI) en Ouganda, sous la direction politique et la coordination de l'Organisation nationale de recherche agricole (NARO). Son mandat est de mener des recherches fondamentales et appliquées d'importance nationale et stratégique dans les domaines de l'aquaculture, des pêches de capture, de l'environnement aquatique, de la socioéconomie et du marketing, ainsi que de la gestion de l'information et de la communication, ainsi que des questions émergentes dans le secteur de la pêche.
En savoir plus.

 

À propos du GBIF Ouganda et de l’UNCST

Le nœud national du GBIF pour l'Ouganda est hébergé au sein du Conseil national ougandais pour la science et la technologie (UNCST), créé en 1990 en tant qu'agence gouvernementale semi-autonome chargée de conseiller, de développer et de mettre en œuvre des politiques et des stratégies d'intégration de la science, de la technologie et du développement de la recherche en Ouganda. Le GBIF Ouganda soutient la mission de l'UNCST consistant à fournir un leadership efficace et innovant dans le développement, la promotion et l'application de la science et de la technologie et leur intégration dans le développement national durable.
En savoir plus.

 

 


 

Jury pour le Prix des Chercheurs diplômés 2023

 

Dorothy Akoth, étudiante en master à l'université de Makarere et lauréate du prix GBIF Graduate Researchers Award 2023.
Photo par Christine Elong / Institut national de recherche sur les ressources halieutiques.

 

Lire l'article original

Un jury d'experts a sélectionné Liz, qui avait été nommé par la délégation portugaise du GBIF, reconnaissant son analyse génétique intégrée et ses schémas de distribution spatiale de 107 espèces de vertébrés qui vivent dans le désert du Sahara-Sahel.

La diversité intraspécifique (DIS) reflète la variation génétique qui se situe au sein d'une espèce individuelle. Bien qu’historiquement non appréciée, la DIS a été inscrite à l’ordre du jour duKunming-Montreal Global Biodiversity Framework. Son importance en tant que mesure de la biodiversité peut être égale à celle de la variation entre les espèces, surtout compte tenu de son statut comme variable clé de la résilience de l'espèce face au changement climatique.

Les vertébrés terrestres sur lesquels se concentre l'étude de Liz ont vécu et évolué à travers les nombreux cycles humides et secs du Sahara-Sahel au cours des dix derniers millions d'années accumulant des niveaux remarquables de DIS. Le vaste et relativement inaccessible paysage de la région a entravé une meilleure compréhension de la structure et des mécanismes qui sous-tendent cette diversité.

La recherche de Liz tire parti de plus de 21 000 observations du GBIF, les utilisant à la fois pour aider à déduire la distribution de 325 lignées génétiques confirmées et pour modéliser les distributions actuelles et historiques de l'espèce. Combiné dans un cadre commun aux scénarios hydrologiques, climatiques et de végétation passés pour la première fois, cette étude intégrée vise à identifier et à corroborer les hot spots de la DIS et à déterminer ses principaux moteurs.

 

« En intégrant ces approches, la méthodologie nous permet d'évaluer l'impact des fluctuations humides et sèches sur la génération et la structuration de la diversité génétique à travers les biomes du Sahara-Sahel, » a dit Liz. « Si nous pouvons comprendre les relations entre la DIS et la variabilité climatique passée, nous avons une meilleure chance d'adapter les plans de conservation afin d'identifier et de protéger efficacement la biodiversité unique du désert contre les menaces liées au changement climatique. »

 

« André est un chercheur déterminé, discipliné et plein de ressources dont la recherche associe la biogéographie de la conservation, la phylogéographie, le changement climatique et le calcul Big Data, >> a déclaré Silvia Carvalho, chercheuse chez CIBIO. « Le prix est une reconnaissance bien méritée de son travail remarquable et de son potentiel exceptionnel en tant que chercheur qui n'a pas peur de relever de nouveaux défis. »

 

« André a magnifiquement travaillé en tant que chercheur et collaborateur depuis qu'il a rejoint notre programme de doctorat en biodiversité, en génétique et en évolution », a dit José Carlos Brito, chercheur principal chez CIBIO-InBIO et superviseur de thèse de Liz. « Ayant déjà publié trois articles dans des revues à fort impact, je m'attends à ce que les deux principaux articles de son doctorat poussés par les données et avec leurs méthodologies à la pointe de la technologie, parviendront à un profil similaire. »

 

Liz est le premier étudiant nommé par le Portugal à remporter le prix depuis Raquel Gaião Silvaqui a été sélectionnée en 2018. Les recherches pour ses études doctorales ont été développées principalement au CIBIO-InBIO et à l'Institut Leibniz pour l''analyse des changements de la biodiversité (LIB Museum Koenig Bonn), avec des séjours de recherche supplémentaires au Centre d'Écologie Fonctionnelle et Evolutive de Montpellier (CEFE-CNRS) et au King's College London. Liz a été soutenu par une bourse de doctorat de la Fundação para a Ciênçia e a Tecnologia (FCT). Tout en complétant l'écriture de sa dissertation, il travaille comme technicien de recherche à BIOPOLIS Association.

Liz partage le prix 2023 avec Dorothy Akoth de l'Université de Makarere en Ouganda, les deux gagnants reçoivent un prix de 5 000 €.

 

À propos du Prix

Depuis sa création en 2010, le prix annuel GBIF Graduate Researchers Award (précédemment le _ the Young Researchers Award_) a promu et encouragé l'innovation en reserche lié à la biodiversité utilisant des données partagées via le the GBIF network.

 

À propos de CIBIO-InBIO

Le Centre de Recherche en Biodiversité et Ressources Génétiques est une unité de recherche reconnue internationalement en sciences biologiques, avec ses sièges sociaux à University of Porto et dans trois autres centres portugais. Le Centre de recherche mène des recherches de base et appliquées sur les trois principales composantes de la biodiversité : les gènes, les espèces et les écosystèmes, et favorise un environnement de recherche international et multiculturel, accueillant des chercheurs de plus de 17 pays, organisés en 34 groupes de recherche.
En savoir plus.

 

À propos de l'association BIOPOLIS

CIBIO-InBIO est géré par l'Association BIOPOLIS, une institution privée à but non lucratif qui se concentre sur la biologie environnementale, la recherche sur les écosystèmes et l'agrobiodiversité. L'association reçoit un soutien financier du Programme de recherche et d'innovation Horizon 2020 de l'Union européenne.
En savoir plus.

 

À propos du projet BIOPOLIS Teaming

Le projet Biopolis est le projet européen Teaming #857251 et comprend trois partenaires : CIBIO (PT), Porto Business School (PT) et l'<3 >Université de Montpellier (FR).


 

Jury pour le Prix des Chercheurs diplômés 2023

 

André Vicente Liz, doctorant au Centre de recherche sur la biodiversité et les ressources génétiques (CIBIO-InBIO) de l'Université de Porto et lauréat du prix GBIF 2023 pour les jeunes chercheurs. Photo de Xarxa Quiroga Álvarez.

 

Lire l'article original

Revenir en haut