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Samedi 09 Novembre 2024

Octobre 2020

Vaughn Shirey, doctorant à la Georgetown University à Washington, D.C., est l'un des deux lauréats du prix GBIF 2020 Bourses pour jeunes chercheurs.

Un jury d'experts a récompensé Shirey, qui a été nommé par la délégation américaine du GBIF, pour les efforts qu'il a déployés afin de remédier au biais des données tout en modélisant les impacts à long terme du changement climatique et de l'utilisation des terres sur une famille bien connue d'organismes dans des régions mal échantillonnées : les papillons (Papilionidea) qui vivent dans les forêts boréales d'Amérique du Nord et d'Europe du Nord.

Les disparités dans la disponibilité des données sur la biodiversité dans l'espace et le temps posent des défis pour la modélisation, la mesure et l'atténuation de menaces telles que le climat et le changement d'affectation des terres. Les forêts boréales du monde étant désormais confrontées à un réchauffement rapide et à une conversion généralisée des terres, la rareté des données provenant de ces environnements de haute latitude ne fait qu'accroître la difficulté et l'urgence de ces défis.

En combinant les données sur les papillons disponibles par le biais du GBIF avec les données sur les caractéristiques extraites de la littérature, les recherches de Shirey examinent une famille d'organismes particulièrement sensibles au changement mondial et fournissent un modèle pour l'utilisation de données présentant des lacunes et des biais connus afin d'analyser les zones de conservation hautement prioritaires. Les résultats synthétisent une étude à grande échelle des tendances de la richesse et de la composition des papillons dans les forêts boréales nord-américaines et européennes entre 1940 et 2019.

« Les données fournies par le GBIF servent ici de base pour faire des déductions sur les communautés de papillons à une époque de changement mondial », a déclaré Shirey. « La technique de "pseudo-échantillonnage" que j'applique, en plus de la prise en compte des comportements des observateurs, peut aider à développer les meilleures pratiques pour l'utilisation d'enregistrements d'occurrences rares et opportunistes pour comprendre la dynamique de la biodiversité. »

« Vaughn est un penseur extrêmement créatif et indépendant qui a tracé sa propre voie depuis son arrivée dans notre laboratoire, ce prix est donc vraiment bien mérité, » a déclaré Leslie Ries, professeur associé de biologie à l'université de Georgetown. « Avec sa combinaison de compétences en sciences des données, sa passion pour le service envers la communauté et son engagement dans le travail de terrain en haute latitude dans une écorégion vaste et difficile sur le plan logistique, Vaughn a toutes les qualités d'un leader pour la prochaine génération d'écologistes. »

« J'ai eu l'occasion de superviser et de travailler avec Vaughn pendant son séjour à Helsinki dans le cadre d'une bourse Fullbright », a déclaré Pedro Cardoso, conservateur des arachnides, des mille-pattes et des mollusques terrestres à Luomus, le Musée finlandais d'histoire naturelle. « Ils avaient déjà un certain nombre d'idées sur la meilleure façon d'utiliser les données du GBIF et de surmonter ses limites, et je n'ai jamais cessé d'être impressionné par sa capacité de travail. Voir Vaughn aller aussi loin et aussi vite n'est pas vraiment une surprise, mais cela me rend quand même très heureux de voir son travail reconnu par une récompense aussi importante ».

« Je suis à la fois impressionné par le dossier de Vaughn et par son potentiel d'approches transformationnelles de l'utilisation des données du GBIF," ; a déclaré Rob Guralnick, conservateur de la biodiversité de l'informatique au Musée d'histoire naturelle de Floride et University of Florida Research Foundation Professor. "Vaughn s'est déjà imposé comme un leader de la prochaine génération dans le domaine de l'informatique de l'écologie et de la biodiversité, notamment en raison de l'accent mis sur l'intégration des approches d'apprentissage automatique dans la synthèse des connaissances et le travail scientifique des citoyens. »

Shirey est le deuxième ressortissant américain à remporter ce prix, après Kate Ingenloff (2018), le premier de Georgetown, et le troisième nommé par les États Unis au GBIF, après Ingenloff et Andrés Lira-Noriega, un chercheur mexicain étudiant alors aux États-Unis, qui a reçu un prix en 2010, l'année d'inauguration du prix.

Shirey partage le prix avec Angel Luis Robles du Mexique. Ils recevront tous deux un prix de 5 000 euros et une reconnaissance lors de la prochaine réunion du conseil d'administration du GBIF.

 

À propos du prix

Depuis sa création en 2010, le prix annuel GBIF des jeunes chercheurs cherche à promouvoir et à encourager l'innovation dans la recherche liée à la biodiversité en utilisant les données partagées par le réseau GBIF.

 

À propos de l'Université Georgetown

Fondée en 1789 par l'archevêque John Carroll, Georgetown est la plus ancienne université catholique et jésuite des États-Unis. Située à Washington, D.C., à Doha, au Qatar et dans le monde entier, l'université de Georgetown est un établissement d'enseignement et de recherche de premier plan, offrant une expérience éducative unique qui prépare la prochaine génération de citoyens du monde à diriger et à faire une différence dans le monde.
Pour plus d'informations, visitez le site Georgetown.edu.

 

Jury du Prix des jeunes chercheurs 2020

  • Enrique Martínez Meyer : Président du jury, comité scientifique du GBIF | Universidad Nacional Autónoma de México (Mexico)
  • Nayarani Barve : University of Florida (India)
  • Jean Ganglo : University of Abomey-Calavi (Benin)
  • Emily Jane McTavish : University of California, Merced (United States)
  • Fatima Parker : SANBI, the South Africa National Biodiversity Institute (South Africa)

 

À gauche, Vaughn Shirey, étudiant en doctorat à l'université de Georgetown, est l'un des lauréats du prix 2020 des jeunes chercheurs du GBIF.
© Photo avec l'aimable autorisation de Vaughn Shirey
À droite, Frittilles bordées d'argent (Boloria selene), Finlande orientale.
© Photo 2020 Jarkko Peltoniemi / iNaturalist Research-grade Observations, sous licence CC BY-NC 4.0.

 

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Angel Luis Robles Fernández, étudiant en master de physique à l'Université Veracruzana à Xalapa, au Mexique, a été nommé l'un des deux lauréats du GBIF 2020 Bourses pour jeunes chercheurs.

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Un jury d'experts a reconnu Robles, qui a été nommé par la délégation mexicaine du GBIF, pour son application innovante sur les données de présence des espèces en aidant à prévoir l'émergence de nouveaux assemblages hôtes-parasites susceptibles de créer des risques pour la santé publique des communautés humaines.

Les chercheurs manquent généralement de connaissances approfondies sur les interactions existant entre les espèces hôtes et leurs agents pathogènes, ce qui limite leur capacité à prévoir de nouveaux appariements qui pourraient mettre en danger des vies humaines ou des moyens de subsistance. En s'appuyant sur des recherches récentes qui montrent l'importance de la phylogénie (ou de la relation évolutive) pour expliquer la variation du nombre de parasites que les espèces hôtes hébergent, M. Robles veut construire une base de données combinant des informations géographiques, phylogénétiques et environnementales sur les paires d'espèces dans quatre assemblages hôtes-pathogènes bien connus :

La combinaison des informations géographiques dérivées du GBIF, des données phylogénétiques de vertlife et des données environnementales de WorldClim permet d'obtenir un grand ensemble de données pour explorer les modèles d'interactions entre des milliers de paires d'espèces hôtes et pathogènes. M. Robles espère que les analyses générées par l'utilisation d'une série d'outils statistiques, d'apprentissage automatique et d'intelligence artificielle pourront quantifier la probabilité que les agents pathogènes trouvent de nouveaux hôtes et fournir des scénarios géographiquement explicites de la sensibilité des hôtes.

« En tant que physicien, mon intérêt dans ce domaine réside dans l'élaboration de modèles théoriques qui expliquent les distorsions statistiques des incidences entre hôtes et agents pathogènes,» a déclaré Robles. « En plus de fournir un autre exemple d'application réussie de méthodes issues de la physique à l'étude des systèmes écologiques, mon étude pourrait fournir des hypothèses pour de futures recherches théoriques et de terrain ou même aider à éclairer la prise de décision dans des domaines scientifiques et politiques pertinents, tels que la gestion des espèces envahissantes et la santé publique. »

« Travailler avec Ángel a été une expérience passionnante dans la recherche de modèles et d'idées connexes qui pourraient générer de véritables recherches et de nouvelles idées pour comprendre la nature, » a déclaré Andrés Lira-Noriega, chercheur à l'Instituto del Ecologia (INECOL) à Xalapa, qui a lui-même remporté un Prix des jeunes chercheurs sa première année. « Je suis heureux de voir qu'il a trouvé l'occasion d'utiliser ses connaissances en physique et ses compétences en programmation dans le problème fascinant et stimulant de la combinaison des dimensions de la biodiversité, dont nous discutons depuis 2016, lorsque nous nous sommes rencontrés pour la première fois, lui en tant que premier cycle universitaire et moi en tant que chercheur nouvellement arrivé à l'INECOL. »

Lira-Noriega a ajouté, « Cette subvention signifie beaucoup à la fois pour Ángel et pour toute la communauté : elle reflète le grand avantage de travailler dans un cadre multidisciplinaire dans un monde qui recherche des données actualisées et librement disponibles pour surveiller la biodiversité, tout en renforçant également l'idée d'insister sur l'examen des idées sous différents angles. »

« Avoir accès à de grands volumes de données permet de tester des hypothèses sur des questions majeures comme le démontre la pandémie actuelle," ; a déclaré Patricia Koleff de CONABIO et chef de la délégation du GBIF au Mexique. "La participation de jeunes étudiants de diverses disciplines est essentielle, et je suis sûre que cette reconnaissance motivera Angel Luis à poursuivre ce type d'études. »

Robles est le cinquième ressortissant mexicain à remporter ce prix, après Juan Manuel Escamilla Mólgora (2016), Emma Gomez-Ruiz (2013), César Antonio Ríos-Muñoz (2011) et Andrés Lira-Noriega (2010). Il est également le troisième étudiant à gagner alors qu'il fréquente une université mexicaine, précédé par Gonzalo Enrique Pinilla Buitrago (2015) et Ríos-Muñoz.

Robles partage le prix avec Vaughn Shirey, un candidat de doctorat aux États-Unis. Ils recevront tous deux un prix de 5 000 euros et une reconnaissance lors de la prochaine réunion du conseil d'administration du GBIF.

À propos du prix

Depuis sa création en 2010, le prix annuel GBIF des jeunes chercheurs cherche à promouvoir et à encourager l'innovation dans la recherche liée à la biodiversité en utilisant les données partagées par le réseau GBIF.

À propos de l'Université Veracruzana

L'Université Veracruzana (UV) est un établissement public d'enseignement supérieur, situé dans l'État de Veracruz, au Mexique. Fondée en 1944, l'UV a dès sa conception une forte vocation sociale et un engagement envers la communauté de Veracruz. Elle est également reconnue au niveau national et international. Pour en savoir plus, consultez le site www.uv.mx/.

À propos de CONABIO

CONABIO — «la Commisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad » (Commission nationale pour la connaissance et l'utilisation de la biodiversité), est une commission interministérielle mexicaine permanente ; son but est de générer la base de connaissances dont le pays a besoin pour les politiques et les décisions publiques en matière de biodiversité. À cette fin, elle se consacre principalement à la création et à la mise à jour du Système national d'information sur la biodiversité (SNIB), au soutien de projets et d'études sur la connaissance et l'utilisation de la biodiversité, à la fourniture de conseils aux organismes gouvernementaux et à d'autres secteurs, à la réalisation de projets spéciaux, à la diffusion des connaissances sur la richesse biologique, au suivi des accords internationaux et à la fourniture de services au public. Il a été créé par accord présidentiel le 16 mars 1992.

Jury du Prix des jeunes chercheurs 2020

Angel Luis Robles Fernández, étudiant en master de physique à l'Universidad Veracruzana, est l'un des deux lauréats du prix 2020 des jeunes chercheurs du GBIF © Photo avec l'aimable autorisation de M. Robles

 

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L’équipe internationale dirigée par Ian Ondo du Royal Botanic Gardens de Kew, développe une plateforme qui améliore la visualisation, tient compte des biais de données et familiarise les utilisateurs avec les bonnes pratiques en matière de modélisation de distribution d'espèces.

Une équipe internationale menée par Ian Ondo, assistant de recherche au Royal Botanic Gardens de Kew, a remporté le premier prix du GBIF Ebbe Nielsen Challenge 2020. Leur projet gagnant, ShinyBIOMOD, est une interface conviviale open source qui étend les fonctionnalités de biomod2, une plateforme reconnue de modélisation de distribution d'espèces.

Ian Ondo a développé ShinyBIOMOD avec Alexandre Antonelli, directeur scientifique du RBG Kew (ainsi que du Gothenburg Global Biodiversity Centre en Suède) et Samuel Pironon, travaillant aux côtés de Wilfried Thuiller et Maya Gueguen du Laboratoire d’Ecologie Alpine, une unité mixte de recherche du CNRS, de l'Université Grenoble-Alpes.

Leur boîte à outils basée sur R vise à aider les utilisateurs de tous niveaux à construire des modèles de distribution d'espèces (SDM) et des modèles de niche écologique (ENM), en leur fournissant des options étape par étape pour explorer, sélectionner et prévisualiser des données supplémentaires tout au long du processus de modélisation.

Les SDMs et ENMs sont des outils qui permettent aux biogéographes et aux biologistes de la conservation de prédire la distribution potentielle des espèces dans l'espace et le temps. Bien qu'ils soient devenus essentiels à la recherche, à la fois pour comprendre les facteurs qui sous-tendent les changements de répartition spatiale et pour détecter les variations dans les aires de répartition des espèces, en particulier dans le contexte des changements environnementaux globaux, l'élaboration de tels modèles est un processus complexe.

« Les processus de création et d'interprétation des SDMs nécessitent une série d'étapes potentiellement sujettes aux erreurs, des compétences pointues en manipulation de données et une compréhension raisonnable des statistiques, ce qui les rend très difficiles à produire pour les non experts en SIG, déclare Ian Ondo. ShinyBIOMOD permet aux chercheurs ou gestionnaires d'avoir accès à une gamme complète d'outils statistiques qui examinent les relations entre les espèces et leur environnement tout en acquérant une compréhension des bonnes pratiques et de l'incertitude derrière les prévisions modélisées ».

Le jury d'experts a sélectionné cinq autres lauréats du Challenge, le prix incitatif annuel qui honore la mémoire du Dr Ebbe Schmidt Nielsen, un leader inspirant dans les domaines de la biosystématique et de l'informatique de la biodiversité et l'un des principaux fondateurs du GBIF.

« Savoir où vivent les espèces et comment elles interagissent aidera l'humanité à relever les défis majeurs auxquels nous sommes confrontés dans le contexte de la crise de la biodiversité et du changement climatique mondial, a déclaré Jurate de Prins de la Société royale belge d'Entomologie-Koninklijke Belgische Vereniging voor Entomologie (SRBE-KBVE), membre du comité scientifique du GBIF et présidente du jury du Challenge. L'équipe de ShinyBIOMOD a appliqué les meilleures pratiques de la bioinformatique, reliant leur plate-forme aux ressources clés de biodiversité et de données environnementales pour permettre à d'autres d'explorer, de comprendre et de révéler les facteurs qui façonnent les aires de distribution des espèces à travers l'espace et le temps ».

Les deux lauréats en deuxième place sont issus du Jardin Botanique de Meise en Belgique. Avec son étude « Lier la nomenclature aux spécimens types », Maarten Trekels automatise le processus de rassemblement des besoins matériels essentiels aux révisions taxonomiques de botanique. Son collègue du JB de Meise, Quentin Groom, a présenté « InteractIAS », qui combine et visualise les interactions entre espèces et les données d'occurrence pour étayer les évaluations des risques par les experts nationaux sur les espèces envahissantes - tâches reflétant sa collaboration avec le Center for Invasion Biology de l'Université de Stellenbosch en Afrique du Sud.

Trois lauréats du troisième prix remportent les dernières places du challenge Ebbe Nielsen de cette année:

  • Navigateur de codes-barres ADN du co-vainqueur du Challenge 2018 Rod Page de l’Université de Glasgow, qui ajoute la recherche de séquence et des informations phylogénétiques et qui enrichit l'affichage des informations pour la quantité croissante d'enregistrements d'occurrences dérivées de séquences disponibles via le GBIF
  • Voyager, une boîte à outils développée par Ivvet Abdullah-Modinou de la British Science Association et Ben Scott du Natural History Museum de Londres qui adapte les données d'occurrence aux voyages nautiques historiques et prend en charge les inférences qui peuvent corriger, améliorer ou même être ajouté aux enregistrements de spécimens marins associés
  • Outil de géoréférencement de masse, un outil open source créé par Luis J. Villanueva de la Smithsonian Institution (qui a partagé le deuxième prix en 2018) qui sépare le géoréférencement de la sélection de localité et le traite comme un service dans le but de réduire les erreurs et de passer à une échelle supérieure pour répondre aux exigences de numérisation d'une collection qui s'accroît de milliers de nouveaux enregistrements chaque mois

En tant que première lauréate de cette année, l’équipe ShinyBIOMOD recevra 15.000 € sur un montant total de 34.000 €. Les deux lauréats du deuxième prix recevront chacun 5.000 € tandis que les lauréats du troisième prix recevront chacun 3.000 €.

Lauréats du prix GBIF Ebbe Nielsen Challenge 2020

Gagnant du premier prix

ShinyBIOMOD : une application R de modélisation de distribution d’espèces
Cette application R fournit une interface conviviale qui facilite la création de modèles de distribution d'espèces (SDMs) et de modèles de niche écologique (ENMs) en guidant les utilisateurs étape par étape tout au long du processus de modélisation. En fournissant une interface conviviale pour le package R bien connu, ShinyBIOMOD simplifie le processus de sélection et d'ajustement des données tout en créant des modèles de distribution d'espèces, que les utilisateurs possèdent ou non des connaissances en programmation. Ils peuvent également se familiariser avec les bonnes pratiques de modélisation au cours d'un flux de travail intuitif qui permet l'exploration et la visualisation de l'effet que leurs choix vont avoir à chaque étape du processus.

Gagnants du deuxième prix

Lier la nomenclature aux spécimens types
Les spécimens types sont essentiels dans toute révision taxonomique, mais ils peuvent être extrêmement difficiles à trouver, qu'ils soient mal étiquetés, non étiquetés comme types ou dispersés dans les collections mondiales. S'appuyant sur des données taxonomiques ouvertes, cette application Jupyter Notebook rassemble un aperçu des matériels botaniques nécessaires à réviser un taxon, en commençant par une recherche des types présents sur GBIF. Des scripts supplémentaires les relient aux protologues taxonomiques originaux du TreatmentBank de Plazi, aux identifiants de collection de l’Index Herbariorum et aux synonymes de l'International Plant Names Index (IPNI) et de Plants of the World Online. Les utilisateurs peuvent également enrichir les informations taxonomiques disponibles en identifiant les erreurs possibles dans la dénomination des spécimens, en signalant les types potentiellement non étiquetés et en tirant parti des connaissances des spécimens apparentés pour découvrir les types cachés dans les collections.

InteractIAS : un Jupyter notebook pour soutenir l'évaluation des risques par les experts sur les espèces envahissantes
Les évaluations des risques sur les espèces envahissantes et exotiques réalisées par les experts jouent un rôle important dans l’information des politiques nationales en matière d’environnement, de commerce et d’infrastructure. Les interactions des espèces envahissantes avec d'autres espèces offrent le meilleur moyen d'évaluer ces risques, mais en l'absence de modèles sophistiqués pour les écosystèmes ou pour les réseaux d'interactions d'espèces complexes, les experts nationaux manquent souvent de preuves pour évaluer les risques potentiels de nouvelles invasions - en particulier pour les espèces envahissantes venant d’autres continents. InteractIAS combine les enregistrements d'occurrences du réseau GBIF avec les données d'interactions d'espèces issues de Global Biotic Interactions (GloBI), permettant aux utilisateurs de visualiser le réseau d'interactions résultant pondéré par les zones d'occupation des espèces. En mettant en évidence les endroits où les espèces existantes d'un pays peuvent faire face à des impacts directs ou indirects des espèces envahissantes, l'application peut aider à guider les évaluations des risques des experts et même déclencher des recherches ciblées.

Gagnants du troisième prix

Navigateur de codes-barres ADN
Les données génomiques issues du codage ADN et de la métagénomique deviennent de plus en plus une contribution importante au GBIF. Le nom taxonomique, la localité et la date qui composent les enregistrements d'occurrence traditionnels se prêtent facilement à l'affichage en listes ou en points sur une carte, mais ces visualisations ignorent ce qui rend les données de séquençage uniques: la séquence. Cette preuve de concept explore des méthodes pour intégrer des outils pertinents pour les occurrences basées sur l'ADN, en particulier l'ajout d'une interface de recherche de séquence et la construction dynamique «sans alignement» d'arbres phylogénétiques. Les extensions futures pourraient intégrer des mesures de la diversité phylogénétique et échantillonner des zones géographiquement comparables, en utilisant des grilles pour construire une carte globale de la diversité phylogénétique.
video | GitHub repo

Voyager
En adaptant les enregistrements d'occurrence du GBIF aux traces de voyages maritimes historiques de découverte, cette application Web visualise la progression de ces voyages comme des expéditions de collecte. Le résultat révèle le travail des nombreux naturalistes qui ont participé à ces expéditions, rassemblant des spécimens qui constituent toujours l'épine dorsale de nombreuses collections d'histoire naturelle à travers le monde. Peut-être plus important encore, la combinaison d'enregistrements d'occurrence du GBIF avec ces données ouvertes pour les journaux de bord de l'International Comprehensive Ocean-Atmosphere Data Set (ICOADS) permet à la communauté de commencer à corriger, augmenter , faire des inférences et même «redécouvrir» des données marines qui pourraient manquer ou manquer de métadonnées clés dans le GBIF. Github

Outil de géoréférencement de masse
Le géo-référencement est une étape importante mais complexe du processus de préparation et de numérisation des données sur les spécimens de musée. Ce défi augmente considérablement avec les 146 millions de spécimens des collections mondiales du Smithsonian, qui ajoutent des milliers de nouveaux enregistrements chaque mois, à la fois à partir de nouveaux spécimens et de spécimens historiques collectés au cours des 150 dernières années nouvellement numérisés. Cet outil open source est un composant essentiel des nouveaux flux de travail que le Smithsonian prépare pour prendre en charge le géo-référencement des enregistrements à grande échelle. En séparant les éléments techniques, informatiques et logiciels et en traitant le géo-référencement comme un service distinct, le personnel des collections se concentre sur la sélection de la bonne localité pour chaque enregistrement et passe moins de temps à s'inquiéter du logiciel et des données. L'approche devrait également réduire les erreurs et les champs de données vides et résoudre d'autres problèmes géo-spatiaux en automatisant les processus d'assurance qualité et de contrôle qualité.

  • Luis J. Villanueva
    Bureau du programme de numérisation, Bureau du dirigeant principal de l'information, Smithsonian Institution

Jury for 2020 Ebbe Nielsen Challenge

Ian Ondo of Royal Botanic Gardens, Kew, led the team developing ShinyBIOMOD, the winning entry in the 2020 Ebbe Nielsen Challenge © Photo courtesy of Ian Ondo

 

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La République d'Ouzbékistan est devenue un participant associé au GBIF et le premier pays d'Asie centrale à rejoindre le réseau. Cet ajout porte le nombre de pays participants au GBIF à 62, et le nombre total de participants officiels à 100, y compris les organisations associées.

Le président de l'Académie des sciences d'Ouzbékistan a signé le Protocole d'accord du GBIF au nom du pays. L'Académie accueillera également la délégation et le réseau nationaux du GBIF.

L'Ouzbékistan est désormais le troisième pays à rejoindre le GBIF après son implication dans le programme BioDATA, suivant la Belarussie et l'Armenie comme exemples démontrant l'efficacité de ce projet dans l'établissement de solides efforts régionaux à travers la collaboration internationale dans l'enseignement supérieur.

Bien qu'il ne participe pas officiellement à BioDATA, l'Ouzbékistan - représenté par deux chercheurs - a participé à un atelier à Douchanbé, au Tadjikistan, en juin 2019, organisé dans le cadre du programme, qui cible la formation aux compétences en matière de données sur la biodiversité dans l'enseignement supérieur. Cet événement faisait suite à la publication des premiers deuxièmes jeux de données de l'Ouzbékistan dans GBIF.org en 2016, avec l'aide et le soutien de la communauté informelle GBIF.ru.

« L'adhésion au GBIF est importante pour l'Ouzbékistan car le pays est reconnu comme le leader de la recherche floristique et phytogéographique dans la région de l'Asie centrale » a déclaré Tojibaev Sh. Komiljon, directeur de l'Institut de botanique de l'Académie des sciences de l'Ouzbékistan, qui devient le chef de la délégation du pays au sein du conseil d'administration du GBIF. « Un projet de grande envergure - la Flore de l'Ouzbékistan - est mis en œuvre grâce à la coopération internationale, et depuis 2016, les trois premiers volumes ont été publiés et les deux volumes suivants sont en cours de préparation pour publication. La base fondamentale de ce projet est la base de données sur la diversité végétale de l'Ouzbékistan et la collection numérisée de l'Herbier national d'Ouzbékistan - la plus grande collection d'herbiers au monde en termes de nombre de plantes d'Asie centrale. Grâce à cela - et avec une équipe active et jeune de scientifiques responsables de la recherche floristique selon les normes modernes - nous disposons d'une énorme quantité d'informations scientifiques originales que nous voulons partager avec nos collègues du monde entier.»

« L'entrée de l'Ouzbékistan dans le GBIF marque une étape importante pour le réseau » a déclaré Tim Hirsch, directeur adjoint du GBIF et chef de l'équipe de participation et d'engagement du Secrétariat. « En tant que premier pays d'Asie centrale à rejoindre notre communauté, cela représente un pas important dans la priorité stratégique du GBIF d'étendre sa participation à des régions où, jusqu'à récemment, il n'y avait que peu ou pas de partage ouvert des données sur la biodiversité. Il reflète un engagement récent et soutenu avec des institutions d'Europe de l'Est, du Caucase et d'Asie centrale, et démontre les grandes possibilités de combler les lacunes tant en matière de données que de participation au GBIF dans ces régions. »

Doublement enclavé et géographiquement situé entre les rivières Amudarya et Syrdarya, l'Ouzbékistan est dominé par les montagnes et le vaste désert de Kyzylkum, ce qui rend le climat subtropical du pays principalement aride, sujet à une désertification intensive et à des sécheresses. La moitié de la population ouzbèke vivant dans les zones rurales, fortement dépendante de l'agriculture irriguée responsable de 90% des cultures du pays, les écosystèmes naturels sont intrinsèquement vulnérables aux interférences antropogéniques.

Avec 4 388 espèces de plantes vasculaires indigènes enregistrées à ce jour, l'Ouzbékistan possède la troisième flore la plus riche en espèces d'Asie centrale avec un grand nombre d'espèces endémiques, menacées et d'importance mondiale. Dix pour cent de la flore sont considérés comme espèces endémiques nationales.

L'Ouzbékistan possède également une faune riche avec plus de 14 000 espèces d'i'nvertébrés et 700 espèces de vertébrés. La faune reptilienne du pays, en particulier, est connue pour son haut niveau d'endémisme, la moitié des espèces se trouvant exclusivement en Ouzbékistan.

Actuellement, les utilisateurs de GBIF.org peuvent accéder à 78 000 occurrences d'espèces en Ouzbékistan, à laquelle ont contribué des éditeurs de Russie, de Colombie, des États-Unis et d'ailleurs. Jusqu'à d'aujourd'hui, 40 études évaluées par les pairs ont utilisé des données publiées par des institutions ouzbèkes pour des analyses scientifiques couvrant des sujets allant de la biogéographie aux effets du changement climatique.

 

Iris warleyensis observé dans la région de Samarkand, Ouzbékistan © Улугбек Кодиров / iNaturalist - CC BY-NC 4.0.

 

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