L'objectif principal du Centre National de la Flore (CNF) est de réaliser toutes les études botaniques en Côte d'Ivoire. Face aux nombreux défis de remobilisation des acteurs et des données, le CNF a reçu une subvention BID en 2016 dans le cadre d'un consortium pour mobiliser, numériser et publier plusieurs jeux de données sur le portail GBIF.org.

Sur la base des résultats obtenus et des enquêtes menées lors du précédent projet, le CNF propose d'augmenter les données de biodiversité disponibles pour la Côte d'Ivoire. Ainsi, les universités et institutions ivoiriennes telles que l'UFR des Sciences Biologiques des Universités Félix Houphouët-Boigny et Pelefero Gon Coulibaly, le Ministère de l'Environnement à travers ses points focaux Biodiversité et l'IPBES contribueront aux données à mobiliser. Outre les plantes, les données couvriront également d'autres groupes d'organismes qui sont très peu représentés dans le GBIF, tels que les animaux et les micro-organismes.

Ainsi, ce projet contribuera à la mobilisation nationale des données sur la biodiversité pour la recherche et la prise de décision en appui au développement durable, puis utilisera et étendra les meilleures pratiques pour la mobilisation et la numérisation des autres données sur la biodiversité. Enfin, le projet développera des réseaux nationaux, régionaux ou thématiques durables pour soutenir le partage et la réutilisation des données.

Informations & calendrier

Financement : 39 688 €

Co-financement : 20 124 €

Type de subvention : Subvention nationale de mobilisation des données sur la biodiversité

Durée : 1 avril 2021 - 31 mars 2023

Programme : BID : Information sur la biodiversité pour le développement

Durée : 1 avril 2021 - 31 mars 2023

Programme : BID : Information sur la biodiversité pour le développement

La biodiversité des sols joue un rôle vital dans les fonctions écosystémiques cruciales autour de la santé humaine, de la nutrition et des loisirs, mais les données sur les organismes qui composent la biodiversité des sols restent sous-représentée.
Date limite : 10 juillet 2022

Afin d'améliorer l'aptitude à l'utilisation des données pour répondre aux questions clés de recherche et de politique, le GBIF et le Soil Biodiversity Observation Network (SoilBON) ont lancé un appel à propositions ouvert à partir de projets pouvant mobiliser des données ouvertes sur la biodiversité des sols.

SoilBON est une collaboration mondiale entre la Global Soil Biodiversity Initiative (GSBI), le Global Soil Laboratory Network (GLOSOLAN), et de nombreux autres partenaires, axée sur une meilleure utilisation des connaissances disponibles sur la biodiversité des sols et les services écosystémiques.

L'appel soutiendra entre cinq et sept projets au total, les chercheurs sélectionnés recevant jusqu'à 5 000 USD par projet. Toutes les données de cette initiative suivront les normes GBIF et les directives d'octroi de licences de données, et les ensembles de données des régions sous-représentées recevront une attention prioritaire.

Début mars 2022, le secrétariat du GBIF a lancé le Club d'utilisateurs des données avec un webinaire d'introduction. Le Club est conçu comme un forum ouvert où une communauté mondiale d'utilisateurs de données sur la biodiversité peut partager des connaissances, accéder à une assistance technique, développer des compétences en matière de données et présenter des recherches alimentées par les données du GBIF.

Le journal GigaByte a publié une série spéciale de 11 articles « Data Release » qui décrivent des ensembles de données sur la biodiversité partagées via le GBIF concernant les vecteurs de maladies humaines.

Ce numéro spécial présente une grande variété de données - plus de 500 000 nouvelles occurrences d'espèces vectrices dans le monde - relatives à la présence, à la propagation et à la diversité des organismes qui transmettent des virus, des bactéries et des parasites à l'homme. Représentant le travail d'auteurs de 31 pays et territoires, la publication est le produit d'un partenariat entre GigaScience Press et le Programme spécial de recherche et de formation sur les maladies tropicales (TDR), hébergé par l'Organisation mondiale de la santé (OMS).

L'accès libre et ouvert aux données sur la biodiversité décrites dans les articles permet la recherche et l'analyse nécessaires pour faire face aux menaces et au fardeau croissant que les maladies à transmission vectorielle font peser sur les écosystèmes et la santé humaine. Le travail des auteurs encourage également le partage de données via le GBIF pour suivre et évaluer des espèces particulières, en particulier là où il comble des lacunes géographiques où la présence de ces organismes n'a pas encore été bien documentée.

La difficulté de mener à bien un appel mondial à de nouvelles données de ce type est réduite en créant des mécanismes d'incitation à la collecte, au partage et à la découverte de données. À l'heure actuelle, l'un des meilleurs moyens de surmonter ces difficultés consiste à publier des data papers, which provide scholarly credit for the researchers whose vital work in this area often fails to receive appropriate recognition. Such papers also serve to drive readers directly to the data available through GBIF.

Un consortium de 22 partenaires dirigé par le Finlandais CSC - IT Center for Science vise à repousser les limites actuelles de la compréhension prédictive de la dynamique de la biodiversité en développant un Biodiversity Digital Twin (BioDT) - Jumeau numérique de la biodiversité -, une infrastructure de pointe qui fournit une modélisation, une simulation et une prédiction avancées. capacités de recherche à long terme sur la biodiversité.

« BioDT sera un projet phare en tant que l'une des premières initiatives de recherche à l'échelle européenne à bénéficier de l'accès au supercalculateur EuroHPC LUMI », a déclaré Jesse Harrison, chef de projet de CSC pour BioDT.
« Cette infrastructure améliorera directement la capacité des chercheurs à relever les défis mondiaux liés à la perte de biodiversité et à la crise climatique, tels que la sécurité alimentaire, les épidémies et les changements apportés aux principales espèces préoccupantes pour les politiques. »

BioDT entend renforcer les prédictions des chercheurs sur la dynamique de la biodiversité mondiale et la manière dont les espèces interagissent avec leur environnement et entre elles. Produire des analyses quantitatives précises est extrêmement difficile en raison de la complexité des processus impliqués. Mais comprendre les forces qui façonnent la biodiversité est essentiel pour gérer les ressources naturelles et atteindre les objectifs de la stratégie de l'UE pour la biodiversité à l'horizon 2030 visant à restaurer la biodiversité en Europe.

En combinant les données et les technologies existantes de manière innovante, BioDT permettra la modélisation et la prédiction des processus d'interaction et de la dynamique entre les espèces et leur environnement de manière applicable dans des domaines allant des sciences de l'environnement, de la terre et du climat à la génomique et aux mathématiques. Les données et les produits du partenariat basé en Europe permettront la modélisation à l'échelle mondiale, fournissant des outils pour promouvoir la gestion durable de la biodiversité de la Terre et de ses écosystèmes.

Les scientifiques des infrastructures de recherche participantes utiliseront le BioDT pour :

• améliorer l'observation des changements de la biodiversité en réponse au changement climatique ou à l'activité humaine
• comprendre la mécanique de la façon dont ces changements se produisent
• prédire les effets de ces changements.

Le secrétariat du GBIF est à la recherche d'un ingénieur expérimenté en fiabilité du site / ingénieur DevOps pour rejoindre notre petite équipe informatique. L'équipe informatique développe, déploie et exploite l'infrastructure et les services d'indexation en temps réel qui alimentent GBIF.org. Nos systèmes desservent des millions d'utilisateurs chaque année et fournissent quotidiennement des milliards d'enregistrements de téléchargements de données.

Le poste est situé au secrétariat du GBIF à Copenhague, au Danemark, dans une équipe de neuf développeurs et ingénieurs. Voici quelques exemples du type de travail que vous effectuerez :

• Remplacement de notre installation Hadoop gérée par Cloudera (HDFS, HBase, YARN, Spark)
• Moderniser notre infrastructure de virtualisation et de calcul avec, par exemple, Kubernetes
• Mise à niveau, personnalisation et amélioration de nos processus de gestion de serveur (Ansible)
• Évaluation des moteurs de workflow et supervision de la migration depuis Apache Oozie

Le niveau de salaire annuel pour le poste équivaut à 91 000,00 € et est exonéré de l'impôt danois sur le revenu.

Fonction et description du poste

• Planification de la capacité et configuration des serveurs colocalisés (3 racks, hébergés dans un centre de données universitaire).
• Effectuer des tâches opérationnelles quotidiennes sur l'infrastructure de GBIF (déploiement, maintenance, configuration, dépannage, surveillance) tout en développant et en soutenant des outils et des processus d'automatisation pour les soutenir.
• Les systèmes de sauvegarde des données et les processus de reprise après sinistre.
• L'infrastructure de construction et de déploiement, y compris différents environnements de test et le déploiement à chaud de nouveaux services.
• Gérer la séparation entre l'infrastructure colocalisée et nos services de cloud public (AWS, Azure et GCS).
• Participer à une assistance sur appel pour aider à maintenir un environnement 24h/24 et 7j/7

Pour postuler, veuillez envoyer un curriculum vitae accompagné d'une lettre de motivation, détaillant vos compétences et qualifications et comment vous envisagez d'ajouter de la valeur au GBIF. Les candidats doivent soumettre leur candidature en anglais par e-mail à SRE_Job@gbif.org, et le poste vacant est ouvert jusqu'à ce qu'il soit pourvu. Veuillez indiquer dans l'application où vous avez vu cette annonce.

Les demandes de renseignements concernant le poste peuvent être adressées à Tim Robertson, responsable de l'informatique, ou à Susanne Sheldon, responsable des ressources humaines.